細胞來源
到目前為止，能夠樹立具有分化成構成身體各式各樣細胞之分化萬能性之細胞來源，主要為來自於胚盤胞期之內部細胞塊所培養而成之胚胎幹細胞，或是由胚胎幹細胞和體細胞所融合之細胞，抑或是由生殖細胞培養而得之細胞。然而，iPS細胞的製作，是首度沒有使用受精卵或是胚胎幹細胞而創造出具有萬能分化能力之幹細胞。
在理論上，具有萬能分化性之細胞，可以經過誘導分化之手段，使其分化成為身體中所有之組織與器官。如果使用人類病患自身細胞所創造出之iPS細胞，則培養出之組織或是器官作為移植回元患者身體內時，將可避開自身免疫系統之攻擊之難題。另一方面，以往人類胚胎幹細胞所產生之道德倫理問題，也可以取得根本的解決方式。因此，iPS細胞可成為再生醫學中，被受注目之重要的細胞來源。
細胞製作
除了再生醫學之套用之外，利用患者本身之細胞所形成之iPS細胞，將其做特定細胞誘導分化後，可以成為良好之人類細胞研究材料，解決以往人類組織細胞索取上之困難點，也可以成為研究致病機轉之良好研究材料。另外，由於由患者本身體細胞得來，可以獲得具有“個別性”、“專一性”之細胞材料，可以針對藥劑或是成為毒性評估的最佳平台。一方面也提供為轉譯醫學之最佳測試材料。也因此，iPS細胞的製作與發現，也成為醫學、藥學或是食品等之安全實驗平台。
此外，當技術成熟後，例如男性細胞也可以製作出卵子，甚至老化細胞的重生，也不再不是不可能的夢想。
