中華人民共和國環境保護部污染物排放總量控制司

內設機構：

根據上述職責，設4個內設機構。
1、綜合處
承擔司內文電、會務、機要、保密、安全、印章、檔案、財務預算、固定資產管理、政務信息與公開、工作計畫與總結等綜合性事務和綜合協調工作；組織擬訂並監督實施總量減排責任制考核制度、排污許可證制度；建立重點污染源台帳；組織開展總量減排核查工作。
2、水污染物總量控制處（簡稱水總量處）
擬訂水污染物排放總量控制制度、規範並監督實施；組織編制主要水污染物總量控制計畫及年度減排方案，並監督實施；組織核定主要水污染物排放總量減排情況；審核新增水污染物排放項目總量指標；負責水污染減排工程運行監督工作。
3、大氣污染物總量控制處（簡稱大氣總量處）
擬訂大氣污染物排放總量控制制度、規範並監督實施；組織編制主要大氣污染物總量控制計畫和年度減排方案，並監督實施；組織核定大氣污染物總量減排情況；審核新增大氣污染物排放項目總量指標；負責大氣污染減排工程運行監督工作。
4、統計處
擬訂環境統計管理制度；組織編制環境統計規劃與計畫，並監督實施；承擔污染源普查工作；承擔環境統計工作；組織編制並發布環境統計年報和統計報告。