2012年3月23日，中國科學技術大學與安徽省立醫院在北京簽署《中國科學技術大學—安徽省立醫院戰略合作框架協定》。安徽省副省長謝廣祥、中國科學院副院長張亞平、中國科學技術大學校長侯建國出席簽字儀式。根據協定，中國科學技術大學與安徽省立醫院將依託各自優勢和資源開展全面戰略合作，共同構建由研究院所、醫療衛生機構等組成的新型國家生命科學與醫學科技創新合作體系，建立前沿生物學科、基礎醫學研究與臨床醫學相結合的轉化與套用聯盟。
2012年10月10日，第九屆校學術委員會第九次會議，田志剛教授匯報“中國科學技術大學醫學中心”的調研、籌建情況。校學術委員會一致同意成立“中國科學技術大學醫學中心”，並提請學校適時啟動醫學院建設。
2012年12月26日，學校正式批准成立“中國科學技術大學醫學中心”（校科字[2012]267號），為學校獨立科研機構，田志剛教授任中心主任。
2013年1月5日，醫學中心任命胡世蓮、許戈良、廉哲雄、王均教授為中心副主任，並成立醫學中心第一屆學術委員會，主任委員為田志剛教授，副主任委員為胡世蓮教授。 2015年1月8日，第十屆校學術委員會第一次全體會議，田志剛主任匯報中國科學技術大學醫學中心建設進展。會議提議學校儘快啟動醫學院籌建工作2015年1月31日，學校正式批准成立醫學院籌備組，在中國科學技術大學醫學中心基礎上，籌建醫學院，廉哲雄教授擔任組長，王均教授、周榮斌教授擔任副組長（校科字[2015]22號）。
中心成員共有教授/特任研究員21人，副教授/特任副研究員14人，含教育部長江學者特聘教授1人，基金委“傑青”獲得者3人，中國科學院“百人計畫”入選者13人，中組部“青年千人計畫”入選者3人，基金委“優青”獲得者3人，教育部新世紀優秀人才支持計畫入選者2人。2014年成員承擔各類科研項目90餘項，包括科技部重大科學研究計畫（首席單位）、國家傳染病重大專項（主持單位）6項，國家自然科學基金創新群體1項（滾動支持），國家傑出青年基金1項，國家自然科學基金重點項目7項等。
中心成員曾獲得2008年國家自然科學二等獎（“介導肝臟損傷與再生的天然免疫識別及其調控機制”，第一完成單位），2011年國家科技進步二等獎（“人體免疫應答影響B型肝炎臨床轉歸及抗病毒療效的研究”，第二完成單位）；“惡性腫瘤細胞可塑性的調控機制及其靶向治療的研究”獲2014年廣東省科學技術獎一等獎（第二單位）。
為進一步落實近期召開的我校“新學期學位與研究生教育工作會議”的精神以及與安徽省省立醫院全面戰略合作框架協定，3月18日下午，我校於安徽省省立醫院召開醫學學科建設工作研討會。張淑林副校長、研究生院古繼寶副院長、校學位辦倪瑞主任以及醫學中心田志剛主任、胡世蓮副主任、許戈良副主任、廉哲雄副主任、王均副主任及多位教授參加了會議。會議由周叢照副院長主持。
省立醫院黨委書記兼醫學中心副主任胡世蓮教授首先對省立醫院的歷史、醫療與科研進展、學科建設等情況進行了介紹。隨後田志剛教授從醫學中心的籌建開始，細緻回顧了我校醫學學科的發展和建設歷程，匯報了我校與省立醫院聯合建設醫學中心的進展，並對我校醫學學科總體現狀進行了分析；省立醫院院長許戈良教授對臨床醫學學科建設情況進行了分析和展望。參會的各位教授對我校醫學學科的建設和發展進行了熱烈討論，並提出了許多建設性意見和建議。
張淑林副校長聽取發言和討論後講話。她肯定了過去兩年多時間醫學學科建設所取得的成績，並建議進一步融合學校和省立醫院的學科優勢、資源優勢和人才優勢，加強醫學學科建設和研究生培養工作，推動以基礎醫學、臨床醫學和藥學相結合的轉化醫學研究的醫學學科建設快速發展。
