(1)氣候系統監測研究;
(2)氣候與環境變化中的物理化學過程研究;
(3)氣候系統多圈層相互作用;
(4)中高層大氣物理化學過程;
此外,該研究所擁有中國氣象局大氣化學重點實驗室。
目前,該研究所牽頭承擔了國家重大基礎研究項目“首都北京及周邊地區大氣、水、土環境污染機理與調控原理”和國家基金委重大項目“長江三角洲低層大氣物理化學過程及其與生態系統的相互作用”。
研究所有一支科研能力強的研究和野外觀測隊伍,目前研究所在職人員35人,其中科學院院士1人,博士生導師2人,研究員7人,副研究員14人,具有博士學位的15人。在新世紀,研究所職工倍加努力,使該所科研業務工作更大發展。2003年該所總計發表科研論文61篇,其中在國內外SCI期刊上發表論文25篇。
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