學院辦公室在院長領導下,組織制定繼續教育學院工作計畫,負責協調院內各教務管理崗位教學安排以及與學校內外相關部門的協調工作。
學院學歷教育中心主管成人高等學歷教育。目前設有夜大學專科、本科、專升本層次的中醫學、中藥學、臨床醫學、護理學、保健按摩等專業;中藥學自學考試。上海中醫藥大學是中藥學專業(專科段、獨立本科段)的高等教育自學考試主考學校。
學院非學歷教育中心接受上海市衛生局、上海市食品藥品監督管理局、上海市人事局等部門的委託,承擔了繼續醫學教育和執(從)業藥師繼續教育的培訓工作。以及面向社會(中醫藥專業技術人員、廣大民眾和港澳台同胞)舉辦多層次多形式的各類中醫藥職稱考試考前輔導班、成人高考輔導班、中醫中藥防病治病、保健養生知識普及和技能(崗位)培訓班。
學院拓展部負責協助學院領導擬定學院的年度發展計畫及中長期發展規劃、新項目開發以及學校系統國家級繼續教育項目組織申報等。
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