概述
CAPs(cleaved amplification polymorphism sequence-tagged sites) CAPs技術又稱為PCR-RFLP,限制性片段長度多態性聚合酶鏈反應(PCR-RFLP)技術。是用特異設計的PCR引物擴增目標材料時,由於特定位點的鹼基突變、插入或缺失數很少,以至無多態出現,往往需要對相應PCR擴增片段進行酶切處理,以檢測其多態性。CAPs標記在二倍體植物研究中可發揮巨大的作用,是PCR標記的有力補充。但在多倍體植物中的套用有一定的局限性。另外,CAPs標記需使用內切酶,這又增加了研究成本,限制了該技術的廣泛套用。原理
PCR-RFLP的基本原理是用PCR擴增目的DNA,擴增產物再用特異性內切酶消化切割成不同大小片段,直接在凝膠電泳上分辨。不同等位基因的限制性酶切位點分布不同,產生不同長度的DNA片段條帶。此項技術大大提高了目的DNA的含量和相對特異性,而且方法簡便,分型時間短。基本流程
1.根據基因名稱查詢序列,設計引物。2.提取基因組DNA。
3.PCR擴增。
4.產物酶切,凝膠電泳。