MK-99是為 艦艇設計的標準防空飛彈射控系統，由三(伯克級)到四(提康德羅加級)具SPG-62照明雷達、MK-82指揮儀(Director)以及資料轉換裝置組成，負責導引導引SM-2防空飛彈攔截目標。MK-99接收由WCS傳來的指令，配合SPY-1雷達傳來的目標資料進行SM-2飛彈的導引；等SM-2進入終端航道，便以SPG-62照明雷達提供終端照明導引。由於SPY-1雷達的精確度遠高於以往的SPS-48 3D對空搜尋雷達，故能直接將目標位置點告訴SPG-62，這使得SPG-62一開始就能直接進行照明導引工作，而不若MK-74/76防空飛彈射控系統中的SPG-51D/55B照明雷達需事先自行搜獲目標才能開始導引 ；因此，SPG-62隻需要發射X頻照射波的功能，不需要搜尋或接收回波，因此省略了G波段的追蹤功能，只具備I頻段的照射功能（只有發射機而沒有接收功能），降低了體積與重量，也連帶簡化了雷達的旋轉與俯仰機構。
