6月30日凌晨零時30分到1時20分，鐵路相關部門和湖南郴州市政府聯合召開“6·29”火車相撞事故情況匯報會。在匯報會上，廣鐵集團的副總經理孫景在介紹了事故人員傷亡和救援救護情況之後，他說，事發乃是因為K9017列車制動失效，擠壞另一道叉，造成機車脫軌，而導致制動失效的原因有很多，設備的原因，或者系統本身的故障都有可能，具體原因有待調查。但通過K9017次列車黑匣子記錄的數據，可以確定的事值乘司機沒有操作失誤，所以沒有直接責任。
有部分聲音對‘制動失效說’提出質疑，無論7月1日調圖前還是後，K9017次都應該比K9063次晚約20～30分鐘進站，如果調度沒有失誤、鐵路信號沒有失效的話，兩列列車都正點運行的情況下，不應該同時出現於郴州站。
K9017次列車編組18節車廂，全部是25G型客車，由南車南京浦鎮車輛有限公司生產，2009年5月4日出廠，配屬廣鐵集團公司長沙車輛段(廣鐵沙段)，6月23日試運行，6月24日正式上線，此次事故為第3趟正式運行。
最終政府公布的事故原因為：該車2號硬座車廂在生產過程中，客車車間三工區六工位員工馮龍安裝第二位車輛制動軟管時，違反操作規定，在沒有確認折角塞門防塵堵是否全部取出的情況下，就安裝了制動軟管，致使防塵堵底蓋遺留在折角塞門內，該防塵堵底蓋在制動風管內呈游離狀態。6月29日，列車運行至京廣鐵路郴州站，司機在進站前進行減速制動時，制動管風壓將防塵堵底蓋吸附在軟管接頭端部，造成制動主管風道堵塞，列車第2至18位車輛制動力突然喪失，導致事故發生。
南京浦鎮車輛有限公司負此事故的全部責任，員工馮龍被刑拘，南京浦鎮的總經理，黨委書記等高層人員也受到了相應的黨紀政紀處分。
在2009年7月15日召開的全路運輸安全電視電話會議上，鐵道部強調，要嚴格注意產品質量驗收把關，有關部門要進一步加強對機車車輛生產製造和鐵路建設施工的安全監管。
此次事故後，各列車車輛生產廠商改進了車輛的生產製造工藝，塑膠折角塞門防塵堵由內嵌式改為外罩式，車廂出廠前的性能試驗之前，增加了制動管的過球試驗，制動軟管的緊固由原來的普通管鉗改成扭力扳手，並規定扭力數值，打上防護標記。
鐵路部門為此事故拍攝了紀錄片《不該遺留的防塵堵底蓋》，再現了這一起事故的發生和原因，以警示鐵路工作者吸取教訓，保證列車的生產質量，從而維護鐵路安全。
