後勤社會化改革正式啟動後，學校決定將原總務處屬於後勤服務人員成建制地從學校人事管理中分出，將行政管理與服務經營分開，並按其新的職能組建後勤服務中心。
一、體制
後勤服務中心隸屬於學校統一領導下的負責全校生活後勤保障服務經營部門。其內部試行企業化管理，模擬社會化運行。按照與學校簽訂的有償服務協定，具體負責水、電、暖、車、餐、宿、物業、綠化、洗浴、洗衣、藥店經營等項服務保障供應工作任務。
二、機制
按照校黨發（ 2000 ） 12 號檔案、校政發（ 2000 ） 27 號檔案規定，後勤服務中心實行經理負責制，人事管理權相對獨立，全員聘用，競爭上崗，建立適應企業化管理新的分配模式。
後勤服務中心可自行確定內設機構和幹部配備，並按學校有關規定聘任、任免，定期進行考核。
後勤服務中心按照《中國共產黨普通高校基層組織工作條例》的規定，設立黨的總支部委員會，在學校黨委領導下，按組織程式開展黨組織和工會活動。
後勤服務中心實行獨立核算、自主經營、自負盈虧、結餘留用的企業化管理，財務管理實行經理負責制，一切經濟活動由經理決策審批，並接受學校財務處業務指導。在未融入高校後勤社會化系統（集團）之前，接受學校對其進行審計監督。
後勤服務中心改制後所使用的校有資產均實行校內評估、重組，逐步進行成本核算，努力實現資產保值、增值。
三、 2000 ～ 2005 年後勤服務項目收費辦法及結算方式一覽表
| 序號 | 服務 項目 | 計量 單位 | 結算 方式 | 服務費單價（元） | ||||||
| 2000 年 | 2001 年 | 2002 年 | 2003 年 | 2004 年 | 05 ～ 06 年 | 2007 年撥 | ||||
| 1 | 教科研 用 水 | 噸 | 甲方按月計付 | 0.75 | 3.05 | 3.53 | 4.19 | 4.19 | 4.08 | 1,084,322 |
| 2 | 教科研 用 電 | 度 | 甲方按月計付 | 0.55 | 0.70 | 0.71 | 0.84 | 0.84 | 0.75 | 1,749,100 |
| 3 | 供暖費 | 建築面積 / 米 2 | 除煤款外 , 按月計付 | 12.50 | 11.00 | 12.09 | 12.58 | 12.58 | 4.30 | 1,559,640 |
| 4 | 運輸費 | 公里 | 每季度計付 | 2.30 3.30 | 3.55 4.93 | 3.55 4.93 | 3.55 4.93 | 1.63 3.00 | 311,943 | |
| 5 | 宿 費 | 每生 / 天 | 甲方按月計付 | 1.00 | 1.00 | 1.11 | 1.14 | 1.14 | 0.84 | 2,081,767 |
| 6 | 物業費 | 按實際發生 | 313,647 | 469,303 | 521,149 | 521,149 | 281,546 | 550,590 | ||
| 7 | 水 電 小 修 | 每年撥付一次 | 11 萬 | 13 萬 | 15 萬 | 15 萬 | 149,000 | 251,443 | ||
| 8 | 綠化費 | 16 萬 | 220,000 | |||||||
| 9 | 公益性用電 | 度 | 每年 | 1 萬 | 1 萬 | 12,020 | 71,195 | |||
| 10 | 洗滌費 | 50 元 / 生 | 每季度 | |||||||
後勤服務中心截止 07 年底，現有職工 592 人（其中：正式職工 135 人，外聘職工 457 人）。管理人員 27 人（其中：書記（處級） 1 人、副總經理（副處長） 2 人、主任 6 人、副主任 3 人、科員 15 人）；工勤 108 人（技師 24 人、高級工 68 人、中級工 5 人、初普工 11 人）；管理人員中現有副高 2 人、中級職稱 10 人、初級職稱 9 人。後勤服務中心截止 10 年底，現有黨員 56 人。
五、服務保障能力
後勤社會化改革以來，學校不斷加大對辦學支撐條件硬體設施資金投入，僅用於更新改造大修生活後勤水、電、暖、車、宿等方面的資金投入累計達 2000 多萬元。
供電： 2002 年學校籌資 528 萬元，更新兩台變壓器及低壓供電設備櫃等，使我校主供變電能力由 2000KVA 增至 4000KVA ，輔供變電能力由 500KVA 增至 1000KVA ，確保辦學及生活用電。
供暖： 2002 年學校投資 216 萬元，對鍋爐及輔機設備進行更新改造。拆除一台 4.2MW/h 鍋爐，新安一台 14MW/h 鍋爐，新安微機控制台、主機櫃、按鈕屏各一組及五台套變頻調幅設備，徹底實現了鍋爐微機自動化控制。還全部更新三台濕式高效除塵器，使供暖除塵脫硫效果達到國家環保二類地區標準，從根上治理了排煙降塵，極大地改善了校園及周邊地區的空氣品質。 2005 年學校投資 263 萬元，再次對鍋爐進行增容改造，拆除兩台 6T/h 熱水鍋爐，安裝一台 20T/h 熱水鍋爐、一台 6T/h 蒸汽鍋爐。截止 2007 年，由學校鍋爐房負責集中供暖面積達 35 萬平方米，總供暖能力為 28MW 。
供水： 2000 年學校投資進行了廢井改水工程，新建和改建家屬、公企兩個泵房，新安裝投用變頻自動供水設備。全校徹底告別吃深井水的歷史，生活用水質量大大提高。
車輛： 2002 年 9 月學校新增 2 台黃海牌大客車， 2003 年 5 月，學校又新購 3 台麵包車。改善車況後，確保了校內公務用車、職工通勤和學生實習用車。
住宿：現有學生宿舍 7 棟（其中：本專科生樓 6 棟、研究生樓 1 棟），建築面積 103,249 萬平方米，住宿房間 2,069 間，床位 11,698 張，生均建築面積 11 平方米 。新樓每寢室實現了本專科生 6 人間、碩士生 4 人間、博士生 2 人間，電視、電話、微機進寢室，大學生的住宿條件明顯改觀。
一伙食：學生食堂（膳食中心）於 2001 年由學校引進社會資金建設，建築面積 6,850 平方米 。 2004 年 7 月，學校決定以建設投入和設備投入的價格收回原飲食中心經營權與全部產權，並交由後勤服務中心經營管理。後勤接管食堂後，重新組建了膳食中心，大膽引進管理人才，抓好隊伍建設，整章建制，微機核算。在學校大力支持下，投入資金 115 萬元（其中：學校投入 70 萬元、中心自投 45 萬元），用於房屋、設備維修等。經過半年多的不懈努力，食堂的整體環境、設施條件、服務管理等各方面都有了一個質的飛躍，就餐人數大幅提升，提前跨入省高校標準化食堂行列，通過了省衛生廳量化考核 A 級企業驗收。
留學生公寓： 2002 年初承接留學生公寓經營以來，進行了裝維修改造，新購設備等，累計投資 85 萬元。 2007 年 8 月再次對包房和三樓客房進行了維修改造，提高了餐宿檔次標準。備有高、中、低檔客房，床位 142 張；餐飲 KVT 包房，每次可接納 200 多人用餐。室內空調， 24 小時熱水，一層大廳設有傳真、複印、打字、美容美髮等，是接待會議、商務洽談、各種宴會的理想場所。
洗衣房：學校 2001 年投入 25 萬元購置大型洗衣、烘乾、熨燙設備， 2007 年 8 月中心自投經費 16 萬元購置一台蒸汽熨平機，提高了生產能力。建設洗衣房主要是直接為學生洗滌床上用品，洗熨能力每月達 6000 余套。此外，還對學生、職工家屬提供日常衣物水洗、乾洗項目，價格優惠，確保質量。
學生浴池： 2003 年學校新建學生浴池，建築面積 1000 平方米 （浴池實際使用面積 750 平方米 ），並投資 60 多萬元對浴池內部進行裝修。浴池新安節能控水自動收費系統，實現了微機化管理，每天可接納 800 餘人洗浴，浴池內設有美容美髮服務項目。
藥店： 2004 年接續經營藥店以來，順利地通過省藥監局對藥品零售企業的 GSP 認證，管理更加規範，效益有所提高。 2005 年又獲得市醫保定點藥店資格。
六、企業理念
目標：建設一流的中醫藥大學 再創一流的後勤服務保障
口號：校興我榮 校衰我恥 我靠企業生存 企業靠我發展
精神：服務第一 愛崗敬業 誠信守則 創新進取
七、集體榮譽
1 ． 2000 年和 2004 年在哈高校宿舍衛生秋季聯檢中，我校分獲排名第一、第二。
2 ． 2001 年，由我校後勤服務中心為牽頭單位，聯合在哈 13 所大學，積極爭取省、市主管部門的支持，辦好涉及在哈高校、中專學生宿舍用電、用水享受居民價格優惠，大大降低辦學成本，減輕學生負擔，此舉受到省教育廳領導的充分肯定和表揚。
3 ．後勤服務中心鍋爐供暖班被學校評為 2000 ～ 2001 年度 “ 三育人 ” 先進班組；公寓部被學校評為 2002 ～ 2003 年度 “ 三育人 ” 先進集體。
4 ．後勤服務中心被學校評為 2000 ～ 2001 年度、 2002 ～ 2004 年度、 200 4 ～ 2006 年度 基層文明單位。公寓部首次獲 2002 ～ 2004 年度學校文明單位建設特殊貢獻獎。
5 ．後勤服務中心直屬黨支部 2003 年被學校黨委評為 “ 先進黨支部 ” 。
6 ．我校鍋爐房連續十多年被省教育廳暨省高校採暖協會授予 “ 標兵鍋爐房 ” 稱號。
7 ．後勤服務中心 2003 年 7 月被省政府殘疾人協調工作委員會授予 “ 全省扶殘助殘先進集體 ” 稱號。
8 ．後勤服務中心黨支部 2004 年 1 月被動力文政街工委授予社區黨建先進集體。
9 ．後勤服務中心和鍋爐房被市政府分別授予 2003 ～ 2004 年度城市供熱先進單位、先進集體。
10 ．後勤服務中心 2004 年 6 月被學校授予本科教學工作水平評估先進集體。
11 ．後勤服務中心 2004 年 11 月被省教育廳、省殘聯、省體育局授予第六屆全國殘運會黑龍江代表團突出貢獻單位。
12 ． 2004 年 12 月，我校被省高校綠專會授予 “ 校園雙十佳 ” 綠化先進單位。
13 ．我校被市政府授予 0 1 ～ 05 年度城市節水先進單位。
14 ．公寓部被學校授予 04 ～ 05 年度服務育人先進集體。
15 ．後勤服務中心被市政府授予 04 ～ 05 年度供熱先進單位。
16 ．我校被高校綠專會授予 05 ～ 06 年度、 06 ～ 07 年度綠化先進單位。
17 ．留學生公寓 2006 年 8 月被省教育廳、省體育局、省殘聯授予第四屆全國特奧會黑龍江代表團愛心貢獻單位。
18 ．公寓部被省高校寓專會授予 05 ～ 06 年度、 07 年度公寓管理先進單位。
19 ．學生公寓 4 號樓 06 年 11 月被省高校寓專會授予 05 ～ 06 年度省高校示範性學生公寓。
