陳塘港內河航道長60公里,主港道北起潭頭鎮克鳳村五門閘,南經港口、塘下、三星、六林、華陽、渡橋至北山連線蓮柄港,長25公里,航道寬6~10米,可通10噸級船隻,支港道渡橋至漳港10公里,王朱至龍峰5公里,還有不少港汊航道可通0.5~2.5噸級船隻。
60年代,填湖墾田,攔河建閘,原來東起東湖,向西經金峰、集仙、嶺南、邊蘭、潭頭14公里航道已不能通航,且因公路運輸發展,陳塘港船隻逐漸減少。1972年,蓮柄港擴建,鑿通龍腰山“朝陽洞”通水通航隧洞,閩江水過洞穿渠引到陳塘港,變季節性通航為常年通航。自五門閘至北山河段過去只通2.5噸級艚船,現可通10噸級輪船。