科室成本是按責任會計理論方法確定責任單位，是責任單位在醫療服務過程中發生的費用總和。
科室成本核算對責任單位在醫療服務過程中發生的費用總和的核算。其目的是加強各層面對成本的控制，通過建立成本責任中心，核算各科成本，將成本形成過程的控制落實到具體科室和個人。科室成本核算是醫院總成本核算的延伸，又是項目成本核算和單病種成本核算的基礎。
二、科室成本核算作
1．實行科室成本核算，有利於做好醫院各層面的成本核算
2．實行科室成本核算，有利於增強職工的成本效益意識
3．實行科室成本核算，有利於衛生資源合理配置
4．實行科室成本核算，有利於正確處理經濟效益和社會效益的關係。
5．實行科室成本核算，提高醫院的整體效益
