資金存管最初是在證券行業中誕生的。用戶進行證券交易的資金，一開始是由證券公司在銀行建立一個賬戶直接管理，但這樣存在很大的風險，因為證券公司可以直接挪用用戶的資金，而沒有任何束縛。
後來，監管層要求客戶資金必須統一由商業銀行存管。在這種存管模式下，證券公司只負責客戶證券交易的管理，資金結算與管理由銀行負責。
需要重點注意的是，為防範券商虛構交易，挪用客戶資金，銀行能夠同時根據證券登記公司的交易結算數據和券商的證券交易、股份管理數據進行核對，避免用戶資金被挪用的可能性。
該制度有效地在證券公司與客戶資金間建立了隔離。也就是說，每一筆資金的流動，是有真實的證券交易背景的，並有數據紀錄，銀行可以核對數據。
延伸到P2P行業，簡而言之就是：網貸平台將平台的交易資金或是風險準備金由銀行管理，平台管理交易，做到資金與交易的分離，使得平台無法直接接觸資金，避免客戶資金被直接挪用。
