專業設定
學院現有製藥工程（含卓越工程師）、藥物製劑、藥學、中藥學、藏藥學、中藥學（彝藥學方向）6個本科專業，1個民族藥物化學二級學科碩士點。全日制在校本科生1100餘人，研究生80餘人 。
師資力量
學院有專兼職教職員工54人，其中教授10人、副教授16人，具有博士研究生學歷教師31人、碩士研究生學歷教師4人。35歲以下青年教師全部具有碩士以上學歷，有9位教師具有海外留學或博士後經歷。研究生培養方面，現有專兼職博士研究生導師3名、碩士研究生導師13名 。
科學研究
學院建有民族藥物製藥工程國家民委重點實驗室、民族醫藥研究院、少數民族藥物研究所、羌醫藥研究所、民族醫藥創新研究與開發實驗室，總面積達2000多平方米。擁有“中藥及民族藥物創新藥物研究與開發”、“中藥及民族醫藥知識與經驗的傳承與整理”、“中藥及民族藥物資源開發與傳統炮製研究”以及“中藥及民族藥物藥效物質基礎及質量標準研究”4個學術研究創新團隊，儀器設備總值近1800餘萬元。同時，建有緊密型校外實習基地5個，鬆散型校外實習基地10多個 。
藥學院教師先後承擔了中藥及民族醫藥領域國家自然科學基金、國家社會科學基金、國家“十一五”科技支撐計畫、國家重大新藥創製等國家、省、市科研課題80餘項，其中國家自然科學基金項目7項，國家社會科學基金項目2項，到校經費達1500餘萬元。累計發表高層次科研學術論文300餘篇，其中發表在國際國內權威學術刊物上並被SCI或EI收錄的論文達80餘篇，影響因子累計100以上，獲得或申請國家發明專利10餘項，榮獲國家、省部級及地方科技進步獎6項，校級教學成果獎和教學質量獎各1項，出版教材及著作10餘部 。
