(一)綜合辦公室：負責會議組織、草擬審計工作的行政規章、發展規劃、綜合性檔案;負責機關綜合協調、編制審計工作規劃、安排年度審計項目計畫;負責全局計算機、網路中心管理和維護、電文管理、網路信息、信訪信息、秘書事務等機關日常政務、事務工作。
(二)法制審理室：負責組織審計業務質量的監督檢查、執法情況的監督檢查;審核與覆核縣審計機關的審計報告、審計意見書和審計決定、督察督辦審計意見、審計決定的落實;接待信訪、參與審計行政複議、應訴;負責縣審計舉報中心工作;負責組織實施審計普法教育和宣傳工作;負責局內的法制宣傳和教育、編寫法制建設方面的規章制度。
(三)財政金融審計室：負責對縣內財政金融部門的審計監督，接受上級審計機關授權對其他部門或項目進行審計。
(四)經濟責任審計室：負責對全縣局級以下領導幹部的經濟責任審計。
(五)行政事業審計室：負責對全縣行政事業部門和單位的審計監督，接受上級審計機關授權對其他部門或項目進行審計。
(六)投資審計室：負責對全縣各項基本建設資及各類國有資金投資項目的審計監督;接受上級審計機關授權對其他投資項目的審計。
