地理位置
肇源港位於松花江上游左岸，黑龍江省肇源縣境內，距哈爾濱水運里程196公里，距縣城約4公里。
肇源港一般水深1．5米，可泊1000噸駁船10艘。地處黑龍江、吉林兩省交界，並為第二松花江和嫩江的匯合處，經濟腹地遼闊、水陸交通方便。水運上航可經大賚、江橋連線嫩江航線，下航可達哈爾濱及中下游沙河子、佳木斯等港站陸上交通有經縣城至肇州肇東和哈爾濱的公路距縣城70公里建有新肇火車站，通過鐵路可達大慶市和吉林省。
歷史進程
早在30年代初期，肇源港的水運就比較活躍。當時，在哈爾濱―肇源―大賚航線上運行的船舶較多。即有官辦船舶運行，也有私人和日本人經營的船舶運行。當時，肇源港口碼頭處於自然狀態，既無停靠設施，也無機械設備，均由船主自營裝卸。中華人民共和國成立後，於1953年正式建立了隸屬於哈爾濱港務局的肇源營業站，併兼營上游的馬克圖、大廟子、三站等簡易站點的水運業務，成為松花江上游的航運中心。
由於工農業生產的不斷發展和貨運量的逐年增加，簡陋的肇源碼頭已不適應港口裝卸的要求，黑龍江航運管理局於1956年投資135萬元，建設肇源航運站，修建了碼頭1000延長米擴建貨場5000平方米，港區道路2000延長米，建築靠船水泥墩4座，初步改變了港口的落後狀態。1960年又投資修建石砌斜坡式護岸，共有客運、雜貨、糧食、木材、煤炭、石油、砂石等10個泊位，貨場總面積9．2萬多平方米。候船室1棟（270平方米）倉庫2棟（800平方米），各類機械41台組，碼頭船1艘，港作（兼供電）船1艘，搬運汽車2輛。
肇源港對於煤炭、砂石等散貨使用皮帶輸送機作業；木材使用起重機作業；雜貨及糧谷基本上為人力操作。裝卸機械化操作比重為85%左右，港口日通過能力為1500噸左右。
肇源在1953年建站時，港口吞吐量僅有8000噸，翌年上升為7萬餘噸。1959年達到14．9萬噸。“文化大革命”期間，港口年生產量徘徊在8萬噸左右。1977年，吞吐量開始回升，達到12．4萬噸。1983年港口吞吐量首次突破20萬噸，創造了歷史最好水平。1985年的港口生產再創歷史最高記錄，吞吐量達到24．9萬噸，比1977年增加了1倍，比1953年提高了30倍。肇源港已成為黑龍江水系中小港站之首。黑龍江航運管理局於1983年將肇源港務站升格為肇源港，由松花江航運局與肇源縣政府雙重領導，以局為主。設有書記兼港長及副書記、副港長等職。港下設貨運、調度、客運站、辦公室、公安派出所等單位。另有集體所有制的裝卸公司，經濟上實行獨立核算，自負盈虧。
肇源新港
肇源新港建設工程是黑龍江省“十五”期間水運重點建設項目，該工程於2003年9月開工，2005年10月全部完工並進行試運行， 2006年5月底前進行正式竣工驗收後投入使用。
肇源新港工程總投資4,710.31萬元，建設地點位於肇源城西3.5公里，松花江左岸灘地，松花江大橋東500米處。地理坐標東經125°05′，北緯45°31′。新港建設規模為年設計吞吐量80萬噸，主要建設內容包括：新建3個泊位，碼頭岸線長度200米；港區陸域面積123900平方米；港內道路16982平方米；建設四級標準疏港道路3.084公里；建設生產生活輔助設施建築面積3701平方米。該項目是黑龍江水繫到目前為止實施的第二大港口建設工程，投資規模僅次於佳木斯港杏林河外貿碼頭。
工程水工建築結構為重力式鋼筋混凝土空心方塊結構，高程為128.30米。裝卸工藝採用台架起重機裝卸船。港口水域包括生產、輔助及生活區三個部分，生產區包括前方作業地帶、倉庫及堆場。
前方作業地頻寬20米，設有門機軌道、排水溝。在江砂泊位和煤炭泊位後方設定相應的江砂堆場及煤炭堆場，在件雜泊位後方設定件雜堆場及倉庫。江砂堆場面積13440平方米，容量78792噸；煤炭堆場面積13440平方米，容量37209噸；件雜堆場總面積為10885平方米。
輔助區設有工具庫、機加機修車間、變電所、流動機械庫、消防水池、地磅房等。
生活區有綜合樓（包括辦公室、通信站、職工宿舍、浴室、小賣部、醫務室、娛樂室等）、鍋爐房、門衛等設施。
沿港區四周設有圍牆，圍牆總長度為1030米。
港內道路環形布置，港區地面向江心一側傾斜，縱向坡度為1‰，路面為混凝土結構次高級路面。
作為黑龍江省第四大港的肇源新港，將成為大慶地區水上運輸的大通道。通過新港，航道向上可延伸至齊齊哈爾，向下可通往哈爾濱、佳木斯、同江。外貿口岸建成後，可通過俄羅斯廟街到達韓國斧山及日本海，實現大慶水上運輸的國際化，該港口也將成為大慶對外開放的又一重要視窗。
隨著肇源新港的建成和松花江大橋的開通及交通環境建設的推進，將為大慶構築公路、水路、鐵路交通的立體網路格局，為石油、農產品外運創造便利條件，區位優勢的提高，顯現了地緣、地域經濟發展的外向度，從而真正實現以交通優勢、繁榮大慶地區流通業的目標。
