秦山第三核電有限公司作為業主負責核電站的建設和營運管理，加拿大原子能有限公司（AECL）負責電站的設計、供貨、建造、調試等總的項目管理。
中國核工業建設集團公司所屬成員單位承擔完成了絕大部分工程建設任務：中國核工業華興建設公司作為土建分承包商承擔了秦山三期重水堆核電站的全部負挖工程和兩個核電機組核島（NSP）的土建施工任務；中國核工業第二二建設公司承擔了秦山三期重水堆核電站兩個核電機組BOP（含常規島）的土建施工任務；中國核工業第二三建設公司作為承包商承擔了秦山三期重水堆核電站兩個核電機組核島（NSP）安裝工程及核島（NSP）和BOP（含常規島）的管道預製工作。
根據契約計畫，秦山三期重水堆核電站一號機組於1998年6月8日澆注第一罐混凝土，於2003年2月12日投入商業運行，建造周期為56個月；二號機組將於2003年11月12日投入商業運行。
經過中國核工業建設集團公司所有參建單位和廣大核電建設者5年多的艱苦奮鬥和努力拚搏， 秦山三期重水堆核電站一號機組已於2002年12月31日比契約計畫提前了43天投入商業運行，；二號機組已於2003年7月24日比契約計畫提前112天投入商業運行。整個核電站建造周期比契約計畫提前3個多月，不僅創造了我國核電站建造周期最短的紀錄，也創造了國際重水堆核電站建設周期最短的紀錄。秦山三期重水堆核電站在建造過程中創造了國際同類坎杜核電站多項施工紀錄,達到了國際核電建設的先進水平，在工程管理上探索出了一條與國際接軌的管理模式，對我國核電發展和實現與國際接軌的規範化管理作出了重大貢獻。
