直運商品銷售的核算直運商品銷售較之一般的倉庫銷售，在核算上有其鮮明的特點，主要是：1.購銷同時發生。商品由供貨方發運至購貨方，既完成了購進，又完成了銷售；2.可隨時結轉銷售成本。直運商品按批次購銷，可清楚地確定每批商品的原進價；3.帳務處理不通過“庫存商品”帳戶，因為商品並不流經批發企業。除非管理或核算上有特殊要求。
在委託供貨單位代辦商品直運和貨款結算的方式下，批發企業帳務處理如下：收到供貨單寄來的代辦向購貨單位結算的托收憑證回單和“直運商品收發貨單”時，借記“應收帳款”科目，貸記“商品銷售收入”科目，同，結轉該批商品成本，借記“商品銷售成本”科目，貸記“商品採購”（或“在途商品”)科目；收到供貨單位的托收憑證後，承付貨款，借記“商品採購”科目，貸記“銀行存款”科目。
實際工作中，因二者在時間上相距較近，為簡化核算上述購進和結轉成本的會計分錄可合併為：借記“商品銷售成本”科目，貸記“銀行存款”科目。在批發企業自派直運員辦理商品發運與貸款結算的方式下，因財會部門收到直運員寄回的向購貨方托收貨款的憑證和供貨方轉來的向批發企業托收貸款的憑證在時間上不一致，因此，核算程式亦有差別：如果先收到直運員寄回的向購貨方托收款項的憑證，應借記“應收帳款”科目，貸記“商品銷售收入”科目，同時，結轉成本，借記“商品銷售成本”科目，貸記“商品採購”科目；待供貨方托收憑證到達後，再借記“商品採購”科目，貸記“銀行存款”科目。如果先收到貸貨方托收憑證，則先借記“商品採購”科目，貸記：“銀行存款”和目；待直運員向購貨方托收貨款的憑證到過後，再借記“應收帳款”科目，貸記“商品銷售收入”科目，同時結轉成本，借記“商品鈞售成本”科目，貸記“商品採購”科目。如果兩方面的憑證於同一天到達，則可作下達會計分錄：借記“應收帳款”科目，貸記“商品銷售收入”科目，同時，借記“商品銷售成本”科目，貸記“銀行存款”科目 。
