生物氧化提金技術的主要優點：
(1)該工藝在生產過程中不產生煙塵，不向大氣排放有害氣體，也不產出硫酸，砒霜等難以向外運輸的產品。與傳統的焙燒工藝相比，有利於環境保護。
(2)生產工藝大部份採用常規的礦物處理設備。基建投資不僅明顯比國外低，與國內已經建成投產的幾種預處理方案比較。除去化學氧化法之外，生物氧化提金技術方案的基建投資是最低的。
(3)生物氧化提金技術的生產工藝運行穩定可靠，操作更容易，從而可進一步降低生產成本、改善操作。
(4)可通過控制氧化作業參數或條件。選擇性地氧化目的礦物，達到高效的浸出效果。該工藝以對列複雜的含砷、高硫、微細包裹型的含金礦石。其適應性更強，資源的利用率更高。
(5)建設規模可大可小。它非常適合我國新的黃金礦山地處邊遠山區，但又相對集中的特點。只要每天能生產或收購幾十噸金精礦就可以建廠。
(6)耗材料容易供應。生物氧化工廠直接生產成本當中基本上是電量和石灰的消耗和人工費用，還有少量化肥(氮、磷、鉀) 一般在當地能解決。
生物氧化提金技術的主要缺點如下：
(1)氧化作業的特料停留時間長，一般需要6天左右;氧化作業礦漿濃度低，一般在18%～2 0%左右;因此，工藝的核心設備氧化應器的容積大(單槽容積達400～900m3);氧化過程的能耗所占比例高( 目前每噸精礦的充氣動力耗約為1 2 0 kw.h.氧化槽攪拌動力消耗約為45kw.h.)，在酸性溶液中氧化，氧化反應槽需要防腐。
(2)不能綜合回收伴生的有價元素。礦石經過生物氧化後，其中伴生的硫、砷、鐵等元素將進入氧化液中。由於目前氧化液的環保處理工藝是中和法。這些元素大部份進入中和渣而被廢棄。另外，氧化液的環保處理成本也較高會產生大量廢渣。
(3)工程菌放大周期長。工藝生產要求的連續性強。如果在生產的“誤操作” 導致菌種大量死亡，則需要幾個星期才能恢復正常生產
(4)生物氧化渣中的細菌代謝物的起泡性易發生冒槽事故，影響浸出作業生產。細菌及其代謝物，在氰化浸出作業中生成大量泡沫，目前生產中用大量消泡劑抑制泡沫，其價格高。用量大，影響生產成本。
