稚龜暫養期結束後進入工廠化養殖階段。
這一階段主要是通過工廠化自動控溫的技術手段，將稚龜――幼龜放養在最佳環境中，加快生長速度，縮短養殖周期。稚龜分批出殼後逐漸進入冬季，在自然狀態下，稚龜體質差的難以越冬，造成死亡多。在人工條件下，給以最佳溫度和全價飼料，採取必要的生態調控措施，冬、春兩季在溫室中飼養，規格可達500g左右，夏季來臨氣溫升高時將幼龜移出溫室進入自然環境的露天池中飼養，幾個月後即可長成1500g的商品龜上市。實踐證明，稚龜階段生長緩慢，當鱷龜達到250克以上生長速度加快，當規格達到500克時移到室外飼養階段生長速度更快，平均每個月可增重200克，其生長速度十分驚人。也就是說，採用工廠化養殖，鱷龜從出生7g左右長成1500g僅需1年的時間，如採用自然溫度養殖，不僅成活率低，要達到1500g的商品龜規格需要養殖時間3年。因此工廠化養殖鱷龜可縮短養殖周期2年。市場千變萬化，早產出有利於抓住機遇，降低單位成本，提高競爭力。
工廠化養殖鱷龜的基本要點：
1）溫室建造。採用節能型溫室不僅投資省，保溫性能提升後節約熱能。屋頂使用兩層薄膜中間夾保溫材料的方法，四面牆體夾保溫材料，特別注意的是室內地面必須安放保溫材料，只有這樣才能保證溫室的保溫節能效果，其實養龜溫室的新建與造冷庫的原理一樣，要確保保溫效果。
2）控溫裝置。小型溫室或大型溫室均可採用先進的專利技術，“龜鱉溫室自動熱水循環節能加溫裝置”，已經獲得國家知識產權局頒發的專利證書，專利號為ZL 01217344.4。該專利最大特點是：使用無煙煤全封閉運行對溫室的空氣和調節池水體進行自動加溫，關鍵是熱水自動循環，保證等溫換水需要，每天耗煤量僅為每平方米500g，節能顯著。
3）增氧設備。溫室中呈現高溫、高密度、高污染特徵，增氧有助於改善水質，幫助有機物分解，減少污染。一般每500平方米溫室配套2.2千瓦的增氧機。
4）進排水系統及池底需一定傾斜，與室外龜池建造的要求相同。排水口用直徑10cm的PVC管插入止水，抽出排水，簡易可行。
5）食台設定。用石棉瓦斜放入龜池中，水下1/3，水上2/3，投餵飼料開始在食台的水下，逐步移到水上投喂，有利於觀察攝食情況並減少殘餌。
6）消毒防病。定期用生石灰漿化水稀釋後全池潑灑，並可採用先進的臭氧發生器定時自動對養龜水體進行消毒，效果好，成本低。
7）飼料配置。最好自己做飼料，買一套小型的飼料生產機組，使用先進的飼料配方，鱷龜飼料基本成分為白魚粉、α-澱粉、植物蛋白、礦物質、維生素、益生菌、益生元，並可添加其它綠色飼料添加劑，以促進的鱷龜的生長，減少營養性疾病發生，提高養殖成活率。
8）飼養管理。對小鱷龜養成階段投餵配合飼料，如果是粉狀飼料需加水、玉米油、魚油做成軟顆粒或團狀，放在食台上。如果養殖的品種是大鱷龜，投餵漂浮在水面的膨化飼料，形成動態的餌料能引誘不愛動的大鱷龜吞食。每天投餵2次，每次投餵量以2小時內基本吃光，僅剩少許為宜。發現水質變化，氨濃度較高，就要及時換水，有條件的養龜場可採用經典的水化學分析方法或現代儀器自動檢測水質，並可採用電腦監控的方法對溫室內鱷龜活動情況進行跟蹤觀察，發現問題立即採取措施。現代技術已經做到自動測試、自動換水、自動分析、自動報警。在飼養過程中要特別提醒的是“等溫換水”。在稚龜從室外移到室內要逐漸升溫，當幼龜移到室外要逐漸降溫，注意溫度的平衡。在養殖全程始終記住12個字：“環境調控、結構調控、生物調控”，並細細品味。
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