事件過程
2013年3月，瀘州醫學院啟動更名“四川醫科大學”工作，並將其列入學校“十二五”發展戰略的重點工作之一。瀘州醫學院建立了8個專項工作小組具體負責材料撰寫等工作任務，各小組組長均由該校領導擔任。
2013年年6月，四川省副省長黃彥蓉召集瀘州市、四川省教育廳、學校主要負責人召開專題會議，研究同意學校更名四川醫科大學列入四川省政府“十二五”規劃。7月，瀘州市委書記蔣輔義帶領市發改、國土資源、住建、環保、衛生、教育、國資、體育等部門負責人，到瀘州醫學院城北校區調研工作，現場解決問題。他要求，要拿出超常規舉措，落實專人負責，跟蹤盯緊各項報件的審批，“瀘州醫學院更名為四川醫科大學一事必須成功”。事實上，瀘州市委其後還專門成立了“推進瀘州醫學院新區建設和更名工作領導小組”，蔣輔義親任組長。
2014年，更名成了瀘州醫學院全校整年的中心工作。4月21日，瀘州醫學院發給四川大學的函件，裡面稱：“瀘州醫學院根據事業發展的需要，擬將學校更名為‘四川醫科大學’，經核查該名稱與貴校華西醫學中心歷史上所使用過的‘華西協和大學’、‘華西大學’、‘四川醫學院’、‘華西醫科大學’名稱不重合，請貴校大力支持我校更名工作。”
2014年5月27日，四川大學校務會對瀘州醫學院更名問題進行了研究，明確做出了“不同意給予瀘州醫學院證明”的決定，並專門給瀘州醫學院回函表明立場，同時將回函抄送給四川省教育廳。
2015年2月26日，教育部官網發布《關於2015年新設定高等學校和經過籌建“去籌”正式設立高等學校的公示》，瀘州醫學院更名“四川醫科大學”也在公示之列，公示期20天。教育部稱，公示期間從未收到任何單位和個人反映不同意見。
2015年4月28日，教育部發函同意瀘州醫學院改名“四川醫科大學”。其後，新校門、新校徽、新公章、新官網陸續發布。
這一更名引起四川大學華西醫學中心海內外老校友的反對。隨後，將近900名老“川醫”校友在給教育部長的公開聯名信後署名，其中30%來自海外。他們要求撤銷這一決定。
2015年6月6日，“四川醫科大學”的新校牌正式授予，瀘州市委市政府還為該校頒發了總額為1億元的“高端人才引進基金”。6月11日，該校發布公開招聘公告，招聘教學、教輔工作人員等總計80人。
2015年6月9日，四川大學也正式向教育部發函，表態“不同意瀘州醫學院更名為四川醫科大學”。四川大學校長辦公室有關負責人還透露，校方如今“已正式向教育部提起行政複議”。
2015年6月16日，南方都市報以《瀘州醫學院更名四川醫科大學 四川大學發函反對》為題進行報導，引發輿論關注。
2015年6月17日下午，教育部派專人到四川大學聽取意見，川大提出“為何在川大明確答覆不同意的情況下瀘州醫學院仍堅持使用此名”、“為何瀘州醫學院更名專家評審委員會中無川大醫學權威”等質疑。
2015年6月19日，教育部新聞發言人續梅稱，針對該起行政複議，教育部規劃司等相關部門正在研究，聽取多方意見，暫未有明確結果。
2015年6月27日，四川醫科大學（原瀘州醫學院）學生中傳出訊息稱，教育部要求將其校名改為“四川第二醫科大學”。
2015年6月28日，網友上傳的圖片顯示，多名四川醫科大學學生表達觀點，“紮根基層服務全川實至名歸有何不可”、“竭盡全力捍吾川醫大”，有的還表示“四川醫科大學學生會全力捍衛我校更名成果”，還有不少學生說要“堅決捍衛合法合理的四川醫科大學”。從圖片能看出，有些學生在揮舞胳膊，情緒激動。
2015年12月14日，教育部發函（教發函[2015]144號）同意四川醫科大學更名為西南醫科大學。
2016年1月17日，四川醫科大學再次更改，新校名：“西南醫科大學”的招牌掛上。相對上次更換校名的八方朝賀，此次，瀘州醫學院顯得低調，但依舊無法阻止校名的再掀波瀾。網友“華西川醫”在微博上發布了多張顯示為“西南醫科大學”校名招牌的圖片。圖片中學校門口的公交站牌顯示，瀘州市222路、236路、288路公車在該站點的站牌已經寫上了“西南醫科大學”的新站名。
2016年1月19日，多個訊息源顯示，作為第三軍醫大學附屬第一醫院的西南醫院，勢必反對這一更名。
2016年1月26日，教育部相關負責人對瀘州醫學院再次更名事件中的熱點問題作出了解釋：1、考慮到高校校名之間歷史和傳承關係以及區域高等學校布局結構實際情況，為維護相關高校合法權益與教育系統和諧穩定局面，同時從貫徹十八屆五中全會精神，增強高等教育服務西南地區基層醫療衛生事業發展能力，最佳化區域高等教育布局出發考慮，所以同意四川醫科大學更名為西南醫科大學。 2、變更為‘西南醫科大學’並不意味著學校層次規格的提高，而是反映了教育部和四川省希望該校利用其地域優勢，發揮其辦學特色，更多承擔服務西南地區基層醫療事業的功能定位。3、針對此前“瀘醫”更名為四川醫科大學時曾予以公示，而此次更名卻未見公示一事，根據有關法律法規的規定和要求，“四川醫科大學”更名為“西南醫科大學”屬高校名稱同層次變更，由教育部直接審批，並無公示的程式要求。
爭議焦點
四川大學華西醫學中心前身為“華西醫科大學”，再往前的名字為“四川醫學院”，簡稱“川醫”。瀘州醫學院改名後的簡稱與此相似，而‘川醫’是社會對華西的公認品牌，故“川醫”老校友認為這會搶走“川醫”的名頭，侵犯了母校的權益，更名後還可能導致社會公眾產生四川大學沒有醫學學科的誤解。同時，由於四川醫學院的英文名“Sichuan Medical College”與四川醫科大學英文名“Sichuan Medical University”極為相近，對於身在國外的川醫校友來說，學歷認證將會存在極大困難，甚至需要四川醫科大學（原瀘州醫學院）方面出具證明。
中國人民解放軍第三軍醫大學第一附屬醫院始建於1929年，1950年更名為“西南醫院”。“西南醫科大學”校名一旦出現，更名後還可能導致社會公眾產生西南醫院為西南醫科大學附屬醫院。可能將對普通公眾造成許多現實的不便，無論是患者尋醫問診可能走錯醫院，或是學子高考報名因校名難辨而大費周章，都將給第三軍醫大學帶來不必要的困擾。更令人不安的是，更名可能造成西南醫院六十餘年的聲譽“被動易主”。
事件影響
2015年4月28日，教育部正式批准升格為多科性本科院校並更名為四川醫科大學。隨後因四川大學原華西部分海外校友以“川醫大”簡稱可能混淆原“四川醫學院”的“川醫”簡稱為由，促使四川大學向教育部提出行政複議申請。經多方反覆協商，最後各方形成“承認四川醫科大學辦學歷史，將四川醫科大學平穩過度更名為西南醫科大學”的一致性意見：過度期間，在校學生可自主選擇四川醫科大學或西南醫科大學畢業證；同時四川大學將對西南醫科大學給予學科建設，人才培養等方面的支持。
各方觀點
瀘州醫學院
瀘州醫學院稱，在四川省歷史上從未有任何學校使用和註冊過“四川醫科大學”這一名稱，其完全符合國家高校設定和《國家事業單位登記管理暫行條例實施細則》的命名原則。該校強調，自己的更名被四川省列入了全省“高校設定十二五規劃”，是經自己申請，四川省政府組織專家考察，並同意上報教育部，最後才得到批准的。該校認為，更名是促進川滇黔渝結合區域經濟社會發展的需要，有利於學校在更高平台上匯聚更多優秀人才，有利於學校加強國際交流合作。
瀘州醫學院黨委書記廖斌不願參與討論，他回復稱教育部和四川省政府正在處理此事，在合適的時候會向社會和媒體做一個書面回應。
瀘州醫學院官方尚未發布更名的公開信息，該校官方網站上仍然顯示為“四川醫科大學”的校名。四川醫科大學相關負責人對記者表示，感謝媒體關心，但對於更名一事，不方便回答媒體問題，“我們是按照省政府的統一部署在進行相關工作。”
教育部
教育部指出，瀘州醫學院是四川省屬高校，四川省政府提出將其改名為四川醫科大學，符合《高等教育法》、《普通高等學校設定暫行條例》、《普通本科學校設定暫行規定》等法律法規和政策的精神。同時，教育部認為‘四川醫科大學’校名歷史上沒有使用過，校名與‘四川醫學院’和‘華西醫科大學’的名稱存在明顯差異，更名為‘四川醫科大學’並沒有不妥之處。
教育部還表示，根據四川省政府設定申請，按照國家規定的“大學”設定和審批程式，經全國高校設定專家委員會專家考察和評議，教育部對瀘州醫學院更名四川醫科大學進行了審批，並在批准設定前向社會進行了為期20天的公示，其間從未收到任何單位和個人反映不同意見，所以最終發文批准瀘州醫學院改名為四川醫科大學 。
後經多方協商，四川省申請將四川醫科大學更名為西南醫科大學。教育部考慮到高校校名之間歷史和傳承關係以及區域高等學校布局結構實際情況，為維護相關高校合法權益與教育系統和諧穩定局面，同時從貫徹十八屆五中全會精神，增強高等教育服務西南地區基層醫療衛生事業發展能力，最佳化區域高等教育布局出發考慮，變更為西南醫科大學並不意味著學校層次規格的提高，而是反映了教育部和四川省希望該校利用其地域優勢，發揮其辦學特色，更多承擔服務西南地區基層醫療事業的功能定位。所以教育部同意了四川醫科大學更名為西南醫科大學。
老校友
實際利益會受影響
瀘州醫學院此次改名屬鳩占鵲巢，會損害老“川醫”的學校名譽。除此之外，校友特別是海外校友的實際利益也受到影響。
在國外，培訓完的醫生若需換教學單位或者申請到新醫院工作，都需要提供原醫學院證明和成績單。這所大學的頻繁更名，已嚴重影響到校友，尤其是畢業證上寫著“四川醫學院”的那32屆醫生。
紐約一位“川醫”校友稱，需要學歷認證時，他只能讓家屬帶著證件回四川大學辦理相關手續。該校友跟國外的諸多校友都認為，如果瀘州醫學院改名成功，以後就更難向外國人解釋學歷的問題，所以海外的校友首先表示反對，國內的校友也紛紛跟進。
還有老校友認為，更名就是為了招收更多學生，以獲取更多的教育資源。一位國內校友稱，每個大學事實上都有類似爭取更多資源的訴求，靠自己努力無可厚非，“但不能損害到別人的利益啊，特別像我們‘川醫’這種老牌名校，需要更多保護”。
川大官方
更名影響川大品牌、校友執業、民眾交流 損害高等教育改革成果
“四川醫科大學”的簡稱易與華西醫科大學(2000年9月已併入四川大學)歷史曾用名“四川醫學院”的簡稱“川醫”混淆，而“川醫”是社會對華西的公認品牌，更名後可能導致社會公眾產生四川大學沒有醫學學科的誤解。
更名對四川大學及其醫學學科造成了嚴重的消極影響，對四川大學海外醫學校友的學歷認定和執業等帶來巨大影響，也會對四川人民民眾醫療衛生服務方面的信息交流帶來很大混亂和不便。
瀘州醫學院更名帶來的混亂將直接損害中國高等教育改革的成果，直接動搖四川大學合校15年來的成果和來之不易的穩定局面。
西南醫院
一封名為《中國人民解放軍第三軍醫大學致信教育部長：反對四川醫科大學更名西南醫科大學》的帖子在網路快速傳播，已有不少專家、教授和醫生通過微信朋友圈轉發該信函內容，並明確表示，反對更名。西南醫院多名不願透露姓名的教授表示，從知曉瀘醫有可能更名西南醫科大學的訊息後，大家一直持反對觀點。
2016年1月18日-20日，西南醫院王正國、孔祥復院士先後上書教育部反對瀘醫更名“西南醫科大學”。
2016年1月26日，西南醫院在官網發了聲明：堅決反對四川省“瀘州醫學院”更名為“西南醫科大學”，並已通過第三軍醫大學向國家教育部申請高校更名行政複議。
專家意見
專家們認為瀘州醫學院的改名是符合相關規定的，從法律層面上來講沒有什麼問題。
法律專家稱，四川醫科大學與華西醫科大學、四川醫學院名稱存在明顯的不同，不會造成社會和公眾的誤解。國內有不少高校名稱類似都沒有出現問題，比如北京工業大學和北方工業大學、哈爾濱工業大學和哈爾濱工程大學、中央美術學院和中國美術學院，這些高校的校名就一字之差，也沒有引起公眾和社會的混淆。
法律專家認為，國內以前從來沒有四川醫科大學的校名，四川省從高等教育發展和布局考慮，申請將瀘州醫學院改名為四川醫科大學，通過相應的專家組考察，進行了公示，履行了相關手續，程式完備，沒有違規之處，具有相應的法律效力。
