清源洞位於清源山頂峰，系清源山三十六岩洞之首，十人稱之為"第一洞天"。進山門順石階而上左側立有明萬曆三十六年（1068年）紀德碑一方，上刻：泉山之句載於漢書，故以名州清源是也。四方賓客，本州士庶，樂慕名勝，遊覽不絕……
清源洞始建於南宋紹興年間，有觀空樓、佛祖殿，裴仙祠等建築。相傳南宋紹
興年間，有裴道人因追趕一條傷害生靈的巨蟒到此，見巨蟒遁入洞中，遂覆以石，坐化於洞口，使巨蟒不能復出為禍，故此洞又名"裴仙洞"。洞頂岩石，山藤攀掛，古色蒼然。洞頂原建?quot;千峰紫翠亭"，現只留下"蛻岩"，羽化登仙"，"有仙則名"等歷代石刻數方。在清源洞的長方形台地原址上，1998年重建了裴仙祠，觀音殿和文昌閣。
清源洞下方不遠處，有明代抗倭名將俞大猷題刻。俞大猷（1503~1580年），字志輔，號虛江，泉州人，一生軍伍40餘年。因抗擊倭寇，抵禦外侮，功勳卓著，威名遠揚，累官都督，與戚繼光同為抗倭英雄，史稱"俞龍戚虎"。後俞大猷功成引退，在石壁上親筆題?quot;君恩山重"四大字。此石為俞大猷少年時在此讀書，翻騰跳躍，訓練武功之地，又稱"練膽石"。在東峰古道的石壁間，尚刻有俞大猷驅逐倭寇，收復莆田的記事石刻一方，是明代抗倭的珍貴史跡。
清源洞的左峰，亦名東岩。其旁是遵岩，因唐代僧人可遵居此故名。可遵建有三塔，遺址尚存。"嘉靖八才子"之首的王慎中曾在遵岩讀書，並著有《遵岩集》。明萬曆已酉（公元1609年）泉州太守姜志禮在岩面上手書"百丈坪"三大字，其岩石面寬闊平坦，亦為俞大猷練功習武之地。
鳳羽清源洞
清源洞位於大理州洱源縣鳳羽鄉境內,鳳羽天馬山的南端，距縣城二十三公里，乘車可以直接到達洞外約500米的地方，三面環山，為古代鳳羽湖泄後流露的岩溶洞。據《 重修鄧川州志》 卷三中載：“清源洞，鳳羽東麓，其水逆流入浪，渡鄧入洱，洞內石門、石柱、石桌、石佛，千態萬壯，不一而足”。又據《 浪彎縣誌略》 載：“清源洞山（舊雲南通志）在縣西南四十里，洞中有水，上承岩滔，清韻如琴（一統志）洞深不可測，中有石田、石床、石棉、石蓮、石獸之類，石筍倒懸，五色畢其泉，即鳳羽河上源也”。在石洞上方，刻有“清源洞”三字，為鄧川御史楊南金手筆。 清源洞洞口很狹窄，僅容一人通過，洞內漆黑，伸手不見五指，遊人需備有照明設備和蠟燭方能進洞，洞內石頭大都以鐘乳石形成，洞內分上、中、下三層，其內均有錯綜複雜的若干小洞，各個洞中的石筍、石獸、石慢、石林奇形怪狀，千姿百態，極為壯觀，游至半里許，忽觀寬敞，中有石田、石洞，再往裡游，景致別呈異樣。淙淙的細流在洞內通過，據傳此洞一直通到鄧川的漏邑村。洞內氣候冷涼、成群，因漆黑和氣候諸原因，勇其全貌者甚少。徐霞客曾游於此地，並“燃松明”進入洞內，作有《游青源記》，在《浪彎縣誌略》和《 徐霞客遊記》 上可找到此篇文章，文中曾寫道，“導者二，一人負松明一筐，一人燃松明為炬以入，但未必觀其全貌”，其它的許多遊客親眼目睹了清源洞奇觀，無不驚奇的。
古時至今每年農曆六月十三為清源洞會期，屆時附近村落男女老少群集祝會，意在祈禱豐年，場面極為熱鬧，到會的人，以游洞為榮幸。
清源洞外有一股清澈透底的溪水經久不息的流過，水質甘甜，是鳳羽河的發源地，灌溉著鳳羽壩一大片良田，民眾能夠直接受益。 洞的周圍樹木繁茂，山澗流水潺潺，四季鳥語花香，清幽雅靜，近年來當地老百姓還籌資在此依山傍水建造了龍王廟。
為充分保護和開發清源洞資源，清源洞於90年代就被列為“西湖省級風景名勝區景點”，並在清源洞附近建立了“清源洞保護站”，這裡是旅遊觀光的處所，也是考察，探險的好去處。
