適應區域
海洋特別保護區（一）海洋生態系統敏感脆弱和具有重要生態服務功能的區域；
（二）資源密度大或類型複雜、涉海產業多、開發強度高，需要協調管理的區域；
（三）領海基點等涉及國家海洋權益的區域；
（四）具有特定保護價值的自然、歷史、文化遺蹟分布區域；
（五）海洋資源和生態環境亟待恢復、修復和整治的區域；
（六）潛在開發和未來海洋產業發展的預留區域；
（七）其他需要予以特別保護的區域。
保護方針
海洋特別保護區實行海洋保護與開發並重、保護優先的方針，有效保護海洋生態環境，科學開發海洋資源，維護海洋權益。
申請和管理
海洋特別保護區審批部門依據海洋功能區劃和海洋特別保護區發展規劃，結合科學論證，對海洋特別保護區建區申請進行審批。領海以外的海洋特別保護區由國務院海洋行政主管部門直接組織建立。建立、調整海洋特別保護區，海洋行政主管部門應當在批准之前向社會公示，徵求公眾意見。
經批准建立的海洋特別保護區範圍和界線，由同級人民政府海洋行政主管部門在適當位置設立界標，並予以公告。海洋特別保護區的撤消、調整和變化，應當報原審批機關批准。已批准建立的海洋特別保護區所在地縣級以上人民政府因地制宜地對保護區實施管理，必要時可以設立專門管理機構，統一負責海洋特別保護區的保護、利用和管理工作。
已批准設立的海洋特別保護區，其管理機構應當在一年內編制完成海洋特別保護區建設規劃，報其上級主管部門批准。國家級海洋特別保護區的建設規劃由國務院海洋行政主管部門批准。
海洋特別保護區可以根據保護與開發的需要和資源及環境的特點，適當劃分出生態保護區、資源恢復區、環境整治區和開發利用區等，分別制定相應的管理目標，並採取針對性的管理措施。
海洋特別保護區內海洋環境保護要求應當符合海洋功能區劃和海洋環境保護規劃，應當採取科學、合理、有效的措施，保護和恢復海洋生態，維護海洋權益。
海洋特別保護區管理機構鼓勵區內的單位和個人參加海洋特別保護區的建設和管理，吸收當地社區居民參與保護區的共管共護，對保護區重大生態保護和資源開發項目採取舉行聽證會或者其他形式，徵求公眾對保護區保護與開發利用活動的意見。
科研機構、大專院校可將海洋特別保護區作為海洋生態保護和資源可持續開發的科研、教學和實驗基地。
海洋特別保護區及區內開發活動使用海域應當按照《海域法》的有關規定進行。
管理機構職責
（一）貫徹落實國家海洋生態保護和資源開發的法律法規與方針政策；
（二）制定保護區管理制度章程；
（三）制定保護區總體規劃與工作計畫；
（四）組織建設保護區基礎管護、監測、科研設施；
（五）組織開展保護區內的日常巡護管理；
（六）組織落實保護區內的生態保護和恢復措施；
（七）組織開展保護區資源可持續利用開發活動；
（八）統籌、協調保護區內保護、開發和權益維護等各項活動；
（九）開展保護區的監測、監視、評價、科學研究活動；
（十）組織開展保護區內宣傳、教育、培訓及國際合作交流等活動；
（十一）建立保護區資源環境及管理信息檔案。
保護措施
嚴禁在海洋特別保護區內建設污染環境、破壞資源、影響景觀的生產生活設施。
在特別保護區內進行海洋和海岸工程建設，必須進行嚴格的海洋環境影響評價。經批准在保護區內建設的海洋及海岸工程建設項目在其施工和運營期間，應嚴格遵守相關法律法規的規定，落實海洋環境保護措施。
嚴禁擅自改變海岸和海底地形地貌。嚴格控制海洋特別保護區內的采砂、圍填海等嚴重影響海洋生態環境的開發利用行為。
確需圍墾灘涂、圍海、填海及採挖海砂、礫石、礦藏或開發海島及周圍海域資源的，應當報有審批權的海洋行政主管部門批准，並採取嚴格的生態保護措施。
嚴禁在海洋特別保護區內進行下列活動：
（一）狩獵、捕撈、採集、買賣保護對象；
（二）炸魚、毒魚、電魚；
（三）直接向海域排放污染物；
（四）加工、銷售、運輸和攜帶以受保護的動植物與岩石等為原材料製作的旅遊紀念品；
（五）擅自移動和破壞海洋特別保護區界標及保護設施。
嚴格保護珍稀、瀕危海洋生物物種和重要的海洋生物洄游通道、產卵場、索餌場、越冬場和棲息地等重要生境。
海洋特別保護區內可建立野生動物救助設施，及時採取緊急救護措施，保護海洋野生動物。
需要在海洋特別保護區內引進外來海洋生物物種的，由海洋特別保護區管理機構組織進行嚴格的科學論證，並報有關主管部門批准。
對於海洋權益類型的海洋特別保護區，嚴禁任何單位和個人破壞領海基點等海洋權益保護設施。從事開發活動，不得影響領海基點的穩定。
海洋特別保護區應當因地制宜採取各類人工生態恢復和修復措施，維護海洋資源、保護海洋生態。
海洋特別保護區內禁止開展與保護區規劃相衝突的開發活動和建設項目，鼓勵開展生態養殖、生態旅遊、休閒漁業、人工繁育等與保護區保護目標相一致的生態型開發利用項目，建立協調的生態經濟模式。
合理控制養殖規模，推廣健康的養殖技術，合理投餌、施肥，養殖用藥應當符合國家和地方有關農藥、獸藥安全使用的規定和標準，防止自身污染。
科學確定旅遊區的遊客容量，合理控制遊客流量，加強自然景觀和旅遊景點的保護，嚴格控制占用海岸線、沙灘的建設項目。生活污水和垃圾的處理，必須實現達標排放和科學處置。
發生海洋環境污染、生態破壞事故和自然災害時，有關部門和單位應當按照應急預案採取措施，消除或者減輕災害。
海洋特別保護區管理機構鼓勵區內的單位和個人參加海洋特別保護區的建設和管理，吸收當地社區居民參與保護區的共管共護，對保護區重大生態保護和資源開發項目採取舉行聽證會或者其他形式，徵求公眾對保護區保護與開發利用活動的意見。
科研機構、大專院校可將海洋特別保護區作為海洋生態保護和資源可持續開發的科研、教學和實驗基地。
現狀
截止2014年4月，中國已有國家級海洋特別保護區56處，總面積達6.9萬平方公里，其中包括海洋公園30處。
國家級海洋自然保護區名錄
序號 | 名稱 | 面積（公頃） |
1 | 丹東鴨綠江口濱海濕地國家級自然保護區 | 101000.00 |
2 | 遼寧蛇島-老鐵山國家級自然保護區 | 14595.00 |
3 | 遼寧雙台河口國家級自然保護區 | 128000.00 |
4 | 大連斑海豹國家級自然保護區 | 672275.00 |
5 | 大連城山頭國家級自然保護區 | 1350.00 |
6 | 昌黎黃金海岸國家級自然保護區 | 30000.00 |
7 | 天津古海岸與濕地國家級自然保護區 | 35913.00 |
8 | 濱州貝殼堤島與濕地國家級自然保護區 | 43541.54 |
9 | 榮成大天鵝國家級自然保護區 | 10500.00 |
10 | 山東長島國家級自然保護區 | 5015.2 |
11 | 黃河三角洲國家級自然保護區 | 153000.00 |
12 | 鹽城珍稀鳥類國家級自然保護區 | 284179.00 |
13 | 大豐麇鹿國家級自然保護區 | 2667.00 |
14 | 崇明東灘國家級自然保護區 | 24155.00 |
15 | 上海九段沙國家級自然保護區 | 42020.00 |
16 | 南麂列島國家級海洋自然保護區 | 20106.00 |
17 | 深滬灣海底古森林遺蹟國家級自然保護區 | 3100.00 |
18 | 廈門海洋珍稀生物國家級自然保護區 | 39000.00 |
19 | 漳江口紅樹林國家級自然保護區 | 2360.00 |
20 | 惠東港口海龜國家級自然保護區 | 1800.00 |
21 | 廣東內伶仃島-福田國家級自然保護區 | 921.64 |
22 | 湛江紅樹林國家級自然保護區 | 20279.00 |
23 | 珠江口中華白海豚國家級自然保護區 | 46000.00 |
24 | 徐聞珊瑚礁國家級自然保護區 | 14378.00 |
25 | 雷州珍稀海洋生物國家級自然保護區 | 46865.00 |
26 | 廣西山口紅樹林生態國家級自然保護區 | 8000.00 |
27 | 合浦儒艮國家級自然保護區 | 35000.00 |
28 | 廣西北崙河口紅樹林國家級自然保護區 | 3000.00 |
29 | 東寨港紅樹林國家級自然保護區 | 3337.00 |
30 | 大洲島海洋生態國家級自然保護區 | 7000.00 |
31 | 三亞珊瑚礁國家級自然保護區 | 5568.00 |
32 | 海南銅鼓嶺國家級自然保護區 | 4400.00 |
33 | 象山韭山列島國家級自然保護區 | 48478.00 |
國家級海洋特別保護區
序號 | 名稱 | 面積（公頃） |
1 | 江蘇海門市蠣岈山牡蠣礁海洋特別保護區 | 1222.90 |
2 | 浙江樂清市西門島國家級海洋特別保護區 | 3080.00 |
3 | 浙江嵊泗馬鞍列島海洋特別保護區 | 54900.00 |
4 | 浙江普陀中街山列島國家級海洋生態特別保護區 | 20290.00 |
5 | 浙江漁山列島國家級海洋生態特別保護區 | 5700.00 |
6 | 山東昌邑國家級海洋生態特別保護區 | 2929.28 |
7 | 山東東營黃河口生態國家級海洋特別保護區 | 92600.00 |
8 | 山東東營利津底棲魚類生態國家級海洋特別保護區 | 9404.00 |
9 | 山東東營河口淺海貝類生態國家級海洋特別保護區 | 39623.00 |
10 | 山東東營萊州灣蟶類生態國家級海洋特別保護區 | 21024.00 |
11 | 山東東營廣饒沙蠶類生態國家級海洋特別保護區 | 8282.00 |
12 | 山東文登海洋生態國家級海洋特別保護區 | 518.77 |
13 | 山東龍口黃水河口海洋生態國家級海洋特別保護區 | 2168.89 |
14 | 山東煙臺芝罘島群海洋特別保護區 | 769.72 |
15 | 山東威海劉公島海洋生態國家級海洋特別保護區 | 1187.79 |
16 | 山東乳山市塔島灣海洋生態國家級海洋特別保護區 | 1097.15 |
17 | 山東煙臺牟平沙質海岸國家級海洋特別保護區 | 1465.20 |
18 | 山東萊陽五龍河口濱海濕地國家級海洋特別保護區 | 1219.10 |
19 | 山東海陽萬米海灘海洋資源國家級海洋特別保護區 | 1513.47 |
20 | 山東威海小石島國家級海洋特別保護區 | 3069.00 |
21 | 遼寧錦州大筆架山國家級海洋特別保護區 | 3240.00 |
國家級海洋公園
序號 | 名稱 | 面積（公頃） |
1 | 廣東海陵島國家級海洋公園 | 1927.26 |
2 | 廣東特呈島國家級海洋公園 | 1893.20 |
3 | 廣西欽州茅尾海國家級海洋公園 | 3482.70 |
4 | 廈門國家級海洋公園 | 2487.00 |
5 | 江蘇連雲港海洲灣國家級海洋公園 | 51455.00 |
6 | 劉公島國家級海洋公園 | 3828.00 |
7 | 日照國家級海洋公園 | 27327.00 |
省級海洋自然保護區
序號 | 名稱 | 面積（公頃） |
1 | 黃驊古貝殼堤省級自然保護區 | 117.00 |
2 | 青島大公島島嶼生態系統自然保護區 | 1603.23 |
3 | 膠南靈山島省級自然保護區 | 3283.20 |
4 | 青島市文昌魚水生野生動物市級自然保護區 | 61.81 |
5 | 廟島群島斑海豹自然保護區 | 173100 |
6 | 海陽千里岩島海洋生態自然保護區 | 1823.00 |
7 | 榮成成山頭省級自然保護區 | 6366.00 |
8 | 煙臺崆峒列島自然保護區 | 7690.00 |
9 | 龍口依島省級自然保護區 | 85.49 |
10 | 萊州淺灘海洋資源特別保護區 | 5519.24 |
11 | 上海市金山三島海洋生態自然保護區 | 46.00 |
12 | 長樂海蚌資源增殖保護區 | 4660.00 |
13 | 泉州灣河口濕地省級自然保護區 | 7008.00 |
14 | 東山珊瑚礁自然保護區 | 3630.00 |
15 | 寧德官井洋大黃魚繁殖保護區 | 19000.00 |
16 | 龍海九龍江口紅樹林自然保護區 | 420.20 |
17 | 南澎列島海洋生態省級自然保護區 | 35679.00 |
18 | 江門中華白海豚省級自然保護區 | 10748.00 |
19 | 陽江南鵬列島海洋生態省級自然保護區 | 20000.00 |
20 | 瓊海麒麟菜省級自然保護區 | 2500.00 |
21 | 儋州白蝶貝省級自然保護區 | 30900.00 |
22 | 文昌麒麟菜省級自然保護區 | 6500.00 |
23 | 海南省清瀾港紅樹林自然保護區 | 2948.00 |
24 | 海南西南中沙群島省級自然保護區 | 2400000.00 |
25 | 閩江河口濕地自然保護區 | 3129.00 |
26 | 臨高白蝶貝省級自然保護區 | 34300.00 |
省級海洋特別保護區
序號 | 名稱 | 面積（公頃） |
1 | 膠州灣濱海濕地省級海洋特別保護區 | 3621.92 |
2 | 台州大陳省級海洋生態特別保護區 | 2160.00 |
3 | 溫州洞頭南北爿山省級海洋特別保護區 | 898.00 |
4 | 瑞安市銅盤島省級海洋特別保護區 | 2208.00 |
5 | 煙臺山海洋生態特別保護區 | 570.65 |
6 | 長島長山尾地質遺蹟海洋特別保護區 | 297.00 |
7 | 日照市大竹蟶-西施舌生態系統海洋特別保護區 | 10256.00 |
8 | 蓬萊市登州淺灘海洋資源省級海洋特別保護區 | 1622.96 |
9 | 煙臺逛盪河口海洋生態特別保護區 | 320.00 |
10 | 招遠砂質海岸海洋特別保護區 | 841.79 |
