地理位置
遺址東西長275米，南北寬260米，面積約7萬平方米，文化層厚1．5－2．5米。1983年－1987年河南省文物研究所進行6次發掘，發掘面積2600多平方米，發現房基30多座，灰坑300多個，陶窯10座，墓葬300多座，出土陶、石、骨和龜甲等遺物數千件。
考古挖掘
2001年4－6月，經國家文物局批准，中國科技大學科技史與科技考古系和河南省文物考古研究所合作，對賈湖遺址進行了第七次發掘。這次發掘面積300多平方米，發現房基8座，灰坑66座，陶窯3座，獸坑2座，墓葬96座，發現陶、石、骨等各種質料的遺物數百件，大量炭化水稻稻粒、豆粒等植物種子，各種魚類、龜、鱉、鹿類、豬、狗等動物骨骼。
房基均為圓形或橢圓形半地穴式，有單間和多間，每間面積2－6平方米，房間有門坎或隔牆。房基附近的灰坑有圓形、橢圓形和不規則形。有的為窖穴，壁上留有台階，有的周圍還有柱洞。
墓葬均為土坑墓，葬式多仰身直肢，個別為側身直肢或俯身直肢，多數墓內有隨葬品，少者一件，多者數十件。少數墓中隨葬有成組龜甲，龜甲多穿孔，孔內裝有不同顏色的小卵石，個別龜甲上有契刻符號，還隨葬有骨笛。
在制陶技術方面，發現的陶窯均為橫穴式，上口近圓形，殘存有火門、火膛、火台、窯壁、煙道和出煙口。出土陶片中以夾砂陶為主，泥質次之，還有夾炭陶、夾雲母陶,以紅色為主，褐色占一定比例，灰色和黑色較少。由於火侯不勻，陶色多不純正，陶胎多呈灰或黑色。器表以磨光和素麵為主，夾砂褐陶和紅陶普遍施赭石色陶衣。紋飾有繩紋、劃紋、戳刺紋、附加堆紋、乳釘紋、齒狀紋、篦點紋和拍印紋等。典型陶器有鑿形足盆形鼎、鑿形足卷沿罐形鼎、筒形角把罐、束頸鼓腰圓底罐、卷沿深腹罐、折沿深腹罐、罐形壺、折肩壺、圓肩圓腹壺、扁腹橫耳壺、斂口缽和淺腹缽等。
石器以磨製為主，有少量打制。農業生產工具有刮削器、弧刃斧、斜刃斧、兩端弧形斧和齒刃鐮。穀物加工工具有鞋底狀四柱足石磨盤和磨棒。還有綠松石飾等。
賈湖骨笛
骨器有骨魚鏢、骨針、骨釵和條形骨器等。還有骨笛，系用鶴類尺骨鑽孔製成，形制固定，多為7孔，有的先刻好等分記號，再鑽孔。標本M282：20，全長22．2厘米，7孔，在第六孔與第七孔之間又鑽小孔，製作精緻，保存完好。經測音，能發出6聲或7聲音階。
重要意義
出土文物賈湖遺址出土木炭標本經碳14測定，距今約7600－8600年（經樹輪校正）。這處早於裴李崗文化的聚落遺址已被命名為賈湖文化，為研究原始聚落形態、生產力水平、原始宗教和社會性質提供了珍貴資料。出土的骨笛，是中國最早的樂器，在中國音樂史上有重要地位。出土的甲骨契刻符號，是中國最早的與漢字起源有關的實物資料
