歷史淵源
古籍所成立之初，以承擔古委會重點項目《全明詩》的編纂為工作重心，開展古籍整理與研究，培養科研和教學的相關人才，並在此基礎上，通過開展對明代文獻的較為系統的整理與研究，進而探討明代社會、文學、哲學的發展進程及其特點，先後設立了明代古籍整理研究室，目錄、版本、校勘學研究室和哲學古籍整理研究室。在此過程中，蔣天樞、顧廷龍、呂貞白、徐鵬、陸樹侖、吳傑、潘富恩等老一輩著名學者曾擔任所專（兼）職教授，對古籍所的創立和發展給予了悉心關懷和指導。
科研與教學格局
經過幾十年的努力，尤其是在章培恆先生的全力帶領指導下，古籍所無論在學科方向還是學術隊伍的建設上，都有了長足的拓進，確立了以古今貫通研究這一新的學術理念為主導、以文獻實證為基礎，古典研究諸學科彼此交叉、相輔相成的科研與教學格局。現有四個博士點和四個碩士點，分別為中國古代文學、中國文學古今演變、中國古典文獻學以及漢語言文字學，另有與哲學學院共建的邏輯學（因明學）專業。
其中中國古代文學與中文系同學科共為國家重點學科，設有上古文學（先秦）、中世文學I（漢魏-南北朝）、中世文學II（唐宋）、近世文學（元明清）等研究方向；中國文學古今演變於2005年被教育部正式批准為二級學科自設博士點，是章培恆先生生前倡設的新興交叉學科，為目前全國高校中唯一的一個專業，設有十三至二十世紀中國文學整合研究、中國文學古今貫通研究、中國文學古今演變的地域性研究等研究方向；中國古典文獻學為復旦大學特色學科，設有版本目錄學、古籍校釋學、文學文獻學、美術文獻與美術史、古籍整理與研究、海外漢籍收藏與研究等研究方向；漢語言文字學與中文系同學科共為國家重點學科，設有漢語史研究方向。
目前有專職研究人員12人，其中教授9人，副教授2人，講師1人；兼職教授6人，兼職研究員1人。已培養碩博士研究生三百餘名，包括數十名日、韓、美等碩博生和高級進修生，現有在讀碩博士研究生百餘名（包括留學生、高級進修生）。
