徐鵬[廈門大學海洋與地球學院閩江學者特聘教授]

徐鵬[廈門大學海洋與地球學院閩江學者特聘教授]

廈門大學海洋與地球學院 閩江學者特聘教授;美國奧本大學博士。

人物簡介

徐鵬,男,1977年3月生,理學博士,廈門大學海洋與地球學院,閩江學者特聘教授。1999年畢業於廈門大學生物學系和海洋學系國家教學與科研人才聯合培養基地班,獲理學學士學位;2002年畢業於中國科學院海洋研究所,獲理學碩士學位;2007年畢業於美國奧本大學(Auburn University)漁業系水產動物基因組和分子遺傳學方向,獲理學博士學位;2007-2008年在美國普渡大學(Purdue University)生物系從事博士後研究,方向為魚類生態基因組學和遺傳學 。2008年獲國際動物遺傳學會(International Society for Animal Genetics)年度最高被引用論文獎。2009年加入中國水產科學研究院,2011年入選中國水產科學研究院“百名科技英才培育計畫”,2012年獲中國水產科學研究院“中青年拔尖人才”稱號,2014年破格晉升研究員。2016年加入廈門大學海洋與地球學院,從事魚類基因組學、基因組選育、魚類基因組生態與分子進化等研究。擔任第四屆中國農業生物技術學會常務理事,國際期刊Frontiers in Livestock Genomics副主編,國際期刊PLoS ONE和GENE編委,上海海洋大學、山西農業大學、浙江海洋學院兼職研究生導師,青島農業大學客座教授。中國科協第264次青年科學家論壇執行主席 ,國家自然科學基金優秀青年基金獲得者,第十七屆茅以升北京青年科技獎獲得者 ,首屆中國水產青年科技獎獲得者 。

徐鵬教授主要從事水產動物基因組資源開發、遺傳工具構建和重要經濟性狀的基因組解析研究,以及主要水產動物的基因組輔助育種研究,聚焦在魚類基因組資源開發、遺傳工具構建、重要性狀遺傳基礎解析、魚類極端環境的基因組適應性計畫機制等方面。先後主持科技部863重點項目課題、公益性行業(農業)科研專項課題和自然科學基金優秀青年基金項目在內的多項國家級項目。已經在Nature Genetics,Nature Communication, Molecular Biology and Evolution, BMC Genomics、Genome Biology等刊物上發表研究論文120餘篇,其中SCI收錄論文90餘篇,主編學術專著1部,參編英文專著3部和中文專著1部。論文已經累計被引用2400餘次,H指數為30。

社會任職

中國農業生物技術學會動物生物技術分會第四屆常務理事(2011-2016)

世界水產學會會員(2012-)

Frontiers in Livestock Genomics雜誌副主編(2011-)

PLoS ONE雜誌編委會委員(2013-)

GENE期刊編委會委員(2014-)

擔任領域內30餘家國際刊物審稿人。

主持項目

國家自然科學基金優秀青年科學基金項目"魚類基因組學和遺傳育種"(2015-2017)(31422057)

國家高技術研究發展計畫(863計畫)“鯉魚和草魚等重要養殖魚類功能基因組研究及套用”項目第一課題“鯉魚等功能基因組資源開發及其資料庫與網站構建”(2011-2015)(2011AA100401)

國家自然科學基金目“基於轉錄組學的瓦氏雅羅魚高鹼適應機制研究”(2012-2014)(31101893)

國家公益性行業(農業)科研專項“水產分子育種共性技術的建立與套用”之“鯉鯽分子標記和基因高通量開發套用及分子育種資料庫與網路平台構建”課題(2009-2013)

國家高技術研究發展計畫(863計畫)“品質優良的轉基因鯉與轉基因唐魚的品種培育”(2009-2011)(2009AA10Z105)

農業部948項目“高信息含量指紋圖譜技術的引進和在鯉物理圖譜構建中的套用”(2010)

中央級公益性科研院所基本科研業務費專項“基於細菌人工染色體的鯉魚基因組學研究”(2009-2011)

獲獎及榮譽

福建省“閩江學者”特聘教授,2016

第一屆中國水產青年科技獎,2016

鯉優良品種選育技術與產業化,國家科技進步二等獎,第五完成人,2015

中國水產科學研究院科技創新團隊,負責人,2015

鯉魚基因組和遺傳多態性研究,中國水產科學研究院大漁創新獎,第二完成人,2014

半滑舌鰨性染色體進化及性別分化和底棲適應機制研究,中國水產科學研究院大漁創新獎,第六完成人,2014

基於細菌人工染色體的鯉魚基因組學研究,中國水產科學研究院科技進步二等獎,第一完成人,2014

國家自然科學基金優秀青年科學基金獲得者,2014

第十七屆茅以升北京青年科技獎,2014

中國水產科學研究院“中青年拔尖人才”暨“天邦人才和諧成長獎勵基金獎”, 2012

中國水產科學研究院“百名科技英才培養計畫”人選,2011

“Animal Genetics”期刊最高被引論文二等獎,國際動物遺傳學會31屆會議,荷蘭阿姆斯特丹,2008

青年科學家獎(Young Scientist Travel Award),國際動植物基因組大會,加州聖地亞哥,2006

代表性論文

1. Xu, P., Zhang, X., Wang, X., Li, J., Liu, G., Kuang, Y., et al. The genome and genetic diversity of the common carp (Cyprinuscarpio). Nature Genetics, 2014(46):1212-1219. 備註:SCI論文 (JCR:Q1 IF:31.616)

2. Xu J, Li JT, Jiang Y, Peng W, Yao Z, Chen B, Jiang L, Feng J, Ji P, Liu G, Liu Z. Tai R., Dong C., Sun X., Zhao Z., Zhang Y., Wang J., Li S., Zhao Y., Yang J., Sun X., #Xu P. 2016. Genomic basis of adaptive evolution: the survival of Amur ide (Leuciscuswaleckii) in an extremely alkaline environment. Molecular Biology and Evolution. 2016 Oct 20:msw230. (JCR:Q1 IF:13.65)

3. Liu, Z., S. Liu, J. Yao, L. Bao, J. Zhang, Y. Li, C. Jiang, L. Sun, R. Wang, Y. Zhang, T. Zhou, Q. Zeng, Q. Fu, S. Gao, N. Li, S. Koren, Y. Jiang, A. Zimin, P. Xu, A. M. Phillippy, X. Geng, L. Song, F. Sun, C. Li, X. Wang, A. Chen, Y. Jin, Z. Yuan, Y. Yang, S. Tan, E. Peatman, J. Lu, Z. Qin, R. Dunham, Z. Li, T. Sonstegard, J. Feng, R. G. Danzmann, S. Schroeder, B. Scheffler, M. V. Duke, L. Ballard, H. Kucuktas, L. Kaltenboeck, H. Liu, J. Armbruster, Y. Xie, M. L. Kirby, Y. Tian, M. E. Flanagan, W. Mu and G. C. Waldbieser (2016). The channel catfish genome sequence provides insights into the evolution of scale formation in teleosts. Nature Communication.

4. Jiang, Y., Feng, S., Zhang, S., Liu, H., Feng, J., Mu, X., Sun, X. and #Xu, P., 2016. Transcriptome signatures in common carp spleen in response to Aeromonashydrophila infection. Fish & Shellfish Immunology, 57, pp.41-48.

5. Jiang, Y., Feng, S., Xu, J., Zhang, S., Li, S., Sun, X. and #Xu, P., 2016. Comparative transcriptome analysis between aquatic and aerial breathing organs of Channaargus to reveal the genetic basis underlying bimodal respiration. Marine Genomics.

6. Peng, W., Xu, Jian., Zhang, Y., Feng, J., Dong, C., Jiang, L., Feng JY., Chen, B., Gong, Y., Chen, L. and #Xu, P. 2016. An ultra-high density linkage map and QTL mapping for sex and growth-related traits of common carp (Cyprinuscarpio) Scientific Reports 6, 26693

7. Xu, J., Feng, J., Peng, W., Liu, X., Feng, J. and #Xu, P., 2016. Development and evaluation of a high‐throughput single nucleotide polymorphism multiplex assay for assigning pedigrees in common carp. Aquaculture Research.

8. Jiang, L., You, W., Zhang, X., Xu, J., Jiang, Y., Wang, K., Ke C., #Xu P. Construction of the BAC Library of Small Abalone (Haliotisdiversicolor) for Gene Screening and Genome Characterization. Marine Biotechnology, 2016. 8(1):49-56.

9. Dong C, Xu J, Wang B, Feng J, Jeney Z, Sun X, #Xu P: Phylogeny and Evolution of Multiple Common Carp (Cyprinuscarpio L.) Populations Clarified by Phylogenetic Analysis Based on Complete Mitochondrial Genomes. Mar Biotechnol 2015, 17(5): 565-575.

10. Zhang, J., Shao, C., Zhang, L., Liu, K., Gao, T., Dong, Z., #Xu, P., Chen, S. A first generation BAC-based physical map of the half-smooth tongue sole (Cynoglossussemilaevis) genome. BMC Genomics, 2014 (15): 215 (JCR:Q1 IF:4.041)

11. Xu, J., Zhao, Z., Zhang, X., Zheng, X., Li, J., Jiang, Y., Kuang, Y., Zhang, Y., Feng, J., Li, C., Li, Q., Zhu. Y., Liu, Y., #Xu, P., Sun, X. Development and evaluation of the first high-throughput SNP array for common carp (Cyprinuscarpio). BMC Genomics, 15:307

社會任職

中國農業生物技術學會動物生物技術分會第四屆常務理事(2011-2016)

世界水產學會會員(2012-)

Frontiers in Livestock Genomics雜誌副主編(2011-)

PLoS ONE雜誌編委會委員(2013-)

GENE期刊編委會委員(2014-)

擔任領域內30餘家國際刊物審稿人。

主持項目

國家自然科學基金優秀青年科學基金項目"魚類基因組學和遺傳育種"(2015-2017)(31422057)

國家高技術研究發展計畫(863計畫)“鯉魚和草魚等重要養殖魚類功能基因組研究及套用”項目第一課題“鯉魚等功能基因組資源開發及其資料庫與網站構建”(2011-2015)(2011AA100401)

國家自然科學基金目“基於轉錄組學的瓦氏雅羅魚高鹼適應機制研究”(2012-2014)(31101893)

國家公益性行業(農業)科研專項“水產分子育種共性技術的建立與套用”之“鯉鯽分子標記和基因高通量開發套用及分子育種資料庫與網路平台構建”課題(2009-2013)

國家高技術研究發展計畫(863計畫)“品質優良的轉基因鯉與轉基因唐魚的品種培育”(2009-2011)(2009AA10Z105)

農業部948項目“高信息含量指紋圖譜技術的引進和在鯉物理圖譜構建中的套用”(2010)

中央級公益性科研院所基本科研業務費專項“基於細菌人工染色體的鯉魚基因組學研究”(2009-2011)

獲獎及榮譽

福建省“閩江學者”特聘教授,2016

第一屆中國水產青年科技獎,2016

鯉優良品種選育技術與產業化,國家科技進步二等獎,第五完成人,2015

中國水產科學研究院科技創新團隊,負責人,2015

鯉魚基因組和遺傳多態性研究,中國水產科學研究院大漁創新獎,第二完成人,2014

半滑舌鰨性染色體進化及性別分化和底棲適應機制研究,中國水產科學研究院大漁創新獎,第六完成人,2014

基於細菌人工染色體的鯉魚基因組學研究,中國水產科學研究院科技進步二等獎,第一完成人,2014

國家自然科學基金優秀青年科學基金獲得者,2014

第十七屆茅以升北京青年科技獎,2014

中國水產科學研究院“中青年拔尖人才”暨“天邦人才和諧成長獎勵基金獎”, 2012

中國水產科學研究院“百名科技英才培養計畫”人選,2011

“Animal Genetics”期刊最高被引論文二等獎,國際動物遺傳學會31屆會議,荷蘭阿姆斯特丹,2008

青年科學家獎(Young Scientist Travel Award),國際動植物基因組大會,加州聖地亞哥,2006

代表性論文

1. Xu, P., Zhang, X., Wang, X., Li, J., Liu, G., Kuang, Y., et al. The genome and genetic diversity of the common carp (Cyprinuscarpio). Nature Genetics, 2014(46):1212-1219. 備註:SCI論文 (JCR:Q1 IF:31.616)

2. Xu J, Li JT, Jiang Y, Peng W, Yao Z, Chen B, Jiang L, Feng J, Ji P, Liu G, Liu Z. Tai R., Dong C., Sun X., Zhao Z., Zhang Y., Wang J., Li S., Zhao Y., Yang J., Sun X., #Xu P. 2016. Genomic basis of adaptive evolution: the survival of Amur ide (Leuciscuswaleckii) in an extremely alkaline environment. Molecular Biology and Evolution. 2016 Oct 20:msw230. (JCR:Q1 IF:13.65)

3. Liu, Z., S. Liu, J. Yao, L. Bao, J. Zhang, Y. Li, C. Jiang, L. Sun, R. Wang, Y. Zhang, T. Zhou, Q. Zeng, Q. Fu, S. Gao, N. Li, S. Koren, Y. Jiang, A. Zimin, P. Xu, A. M. Phillippy, X. Geng, L. Song, F. Sun, C. Li, X. Wang, A. Chen, Y. Jin, Z. Yuan, Y. Yang, S. Tan, E. Peatman, J. Lu, Z. Qin, R. Dunham, Z. Li, T. Sonstegard, J. Feng, R. G. Danzmann, S. Schroeder, B. Scheffler, M. V. Duke, L. Ballard, H. Kucuktas, L. Kaltenboeck, H. Liu, J. Armbruster, Y. Xie, M. L. Kirby, Y. Tian, M. E. Flanagan, W. Mu and G. C. Waldbieser (2016). The channel catfish genome sequence provides insights into the evolution of scale formation in teleosts. Nature Communication.

4. Jiang, Y., Feng, S., Zhang, S., Liu, H., Feng, J., Mu, X., Sun, X. and #Xu, P., 2016. Transcriptome signatures in common carp spleen in response to Aeromonashydrophila infection. Fish & Shellfish Immunology, 57, pp.41-48.

5. Jiang, Y., Feng, S., Xu, J., Zhang, S., Li, S., Sun, X. and #Xu, P., 2016. Comparative transcriptome analysis between aquatic and aerial breathing organs of Channaargus to reveal the genetic basis underlying bimodal respiration. Marine Genomics.

6. Peng, W., Xu, Jian., Zhang, Y., Feng, J., Dong, C., Jiang, L., Feng JY., Chen, B., Gong, Y., Chen, L. and #Xu, P. 2016. An ultra-high density linkage map and QTL mapping for sex and growth-related traits of common carp (Cyprinuscarpio) Scientific Reports 6, 26693

7. Xu, J., Feng, J., Peng, W., Liu, X., Feng, J. and #Xu, P., 2016. Development and evaluation of a high‐throughput single nucleotide polymorphism multiplex assay for assigning pedigrees in common carp. Aquaculture Research.

8. Jiang, L., You, W., Zhang, X., Xu, J., Jiang, Y., Wang, K., Ke C., #Xu P. Construction of the BAC Library of Small Abalone (Haliotisdiversicolor) for Gene Screening and Genome Characterization. Marine Biotechnology, 2016. 8(1):49-56.

9. Dong C, Xu J, Wang B, Feng J, Jeney Z, Sun X, #Xu P: Phylogeny and Evolution of Multiple Common Carp (Cyprinuscarpio L.) Populations Clarified by Phylogenetic Analysis Based on Complete Mitochondrial Genomes. Mar Biotechnol 2015, 17(5): 565-575.

10. Zhang, J., Shao, C., Zhang, L., Liu, K., Gao, T., Dong, Z., #Xu, P., Chen, S. A first generation BAC-based physical map of the half-smooth tongue sole (Cynoglossussemilaevis) genome. BMC Genomics, 2014 (15): 215 (JCR:Q1 IF:4.041)

11. Xu, J., Zhao, Z., Zhang, X., Zheng, X., Li, J., Jiang, Y., Kuang, Y., Zhang, Y., Feng, J., Li, C., Li, Q., Zhu. Y., Liu, Y., #Xu, P., Sun, X. Development and evaluation of the first high-throughput SNP array for common carp (Cyprinuscarpio). BMC Genomics, 15:307

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