張魯嘉

簡介

男，講師。華東理工大學教師。主要研究方向為計算生物學和生物信息學以及高性能計算在生命科學研究中的套用。本科、碩士研究生畢業於南京工業大學，師從工業生物技術領域專家歐陽平凱院士和徐虹教授。畢業後在華東理工大學生物工程學院工作(同時攻讀在職博士)，具有非常良好的生命科學和化學知識背景。自幼接觸計算機，與計算機的發展一起成長，對軟體硬體都非常熟悉。中學時期通過首屆全國計算機等級考試，是當時最年輕的考生之一。本科和研究生階段設計開發的“L-蘋果酸生產計算機模擬”軟體曾獲校研究生創新計畫一等獎。熟練掌握C++、Fortran、Python等多種程式語言，熟悉大規模高性能計算硬體與軟體，熟悉分子對接、分子動力學、量子化學等生物化學計算軟體，並已自主開發了多個計算生物學軟體。承擔了大量工業酶開發套用項目中酶的結構功能計算分析及設計改造的工作，取得了顯著的成果。

受教育經歷

2007/09-，華東理工大學，生物工程學院，博士（在職）

2001/09-2004/06，南京工業大學，製藥與生命科學學院，碩士

1997/09-2001/06，南京工業大學，製藥與生命科學學院，學士

研究經歷

2004/12-今，華東理工大學，生物工程學院，講師

所獲獎勵

2012年，上海市科技進步獎，一等獎

2010年，上海市科技進步獎，一等獎

2006年，上海市科技進步獎，三等獎

軟體著作權屬

蛋白熱穩定計算分析系統。功能：通過計算蛋白質中電荷的相互作用，分析其熱穩定性。編寫語言：C++。（申請中……）

計算機輔助酶的底物篩選系統。功能：採用計算機虛擬篩選酶的潛在底物。編寫語言：C++&python。（申請中……）

科研項目

2012年-2015年，國家“863”項目，酶分子規模化改造計算設計關鍵技術研究及套用，子課題負責人

2012年-2014年，基於高性能計算的脂肪酶虛擬底物篩選系統的設計與開發，中央高校基本科研業務費專項資金資助，課題負責人

2011年-2013年，脂肪酶催化生物質衍生物的反應機制研究，材料化學工程國家重點實驗室開放課題，課題負責人

2012年-2016年，微生物藥物創新與優產的人工合成體系，國家“973”項目，主要參與者（負責其中蛋白質工程的部分工作）

2009年-2013年，新一代生物催化和生物轉化的科學基礎，國家“973”項目，主要參與者（負責其中酶分子設計改造的部分工作）

2011年-2014年，新型生物催化劑創製方法及其產業化套用技術，華東理工大學交叉學科與重大項目培育基金，主要參與者（負責其中計算生物學的部分工作）

2006年-2009年，脂肪酶在甘油二酯中的套用，國家“863”項目，主要參與者（負責其中計算生物學的部分工作）

代表性學術論文

Jinliang Zhang, Sha Li, Hong Xu, Peng Zhou, Lujia Zhang,Pingkai Ouyang. Purification of xylitol dehydrogenase and improved production of xylitol by increasing XDH activity and NADH supply in Gluconobacter oxydans. Journal of agricultural and food chemistry. 2013.

湯曉芒, 張魯嘉, 崔東冰, 姚志強, 王學東,魏東芝. 通過分析來自 Pyrococcus abyssi 的腈水解酶中帶電基團位置變化探討蛋白耐熱機制. 生物加工過程. 2012, 10(6): 29-33.

Chun Zhang, Kai Fan, Weitao Zhang, Ruixin Zhu, Lujia Zhang,Dongzhi Wei. Structure-based characterization of canine-human chimeric uricases and its evolutionary implications. Biochimie. 2012.

Huiting Song, Lichao Zhou, Lujia Zhang, Bei Gao, Dongzhi Wei, Yaling Shen, Rui Wang, Catherine Madzak,Zhengbing Jiang. Construction of a whole-cell catalyst displaying a fungal lipase for effective treatment of oily wastewaters. Journal of Molecular Catalysis B-Enzymatic. 2011, 71(3-4): 166-170.

Bei Gao, Tao Xu, Jinping Lin, Lujia Zhang, Erzheng Su, Zhengbing Jiang,Dongzhi Wei. Improving the catalytic activity of lipase LipK107 from Proteus sp. by site-directed mutagenesis in the lid domain based on computer simulation. Journal of Molecular Catalysis B-Enzymatic. 2011, 68(3-4): 286-291.

Tao Xu, Lujia Zhang, Xuedong Wang,Dongzhi Wei. A novel protocol of energy optimisation for predicted protein structures built by homology modelling. Molecular Simulation. 2010, 36(13): 1104-1109.

Tao Xu, Lujia Zhang, Erzheng Su, Dongbing Cui, Xuedong Wang,Dongzhi Wei. Disparity in productive binding mode of the slow-reacting enantiomer determines the novel catalytic behavior of Candida antarctica lipase B. Journal of Molecular Catalysis B-Enzymatic. 2010, 62(3-4): 288-296.

Tao Xu, Bei Gao, Lujia Zhang, Jingpin Lin, Xuedong Wang,Dongzhi Wei. Template-based modeling of a psychrophilic lipase: Conformational changes, novel structural features and its application in predicting the enantioselectivity of lipase catalyzed transesterification of secondary alcohols. Biochimica Et Biophysica Acta-Proteins and Proteomics. 2010, 1804(12): 2183-2190.

Tao Xu, Lujia Zhang, Xuedong Wang, Dongzhi Wei,Tianbi Li. Structure-based substrate screening for an enzyme. Bmc Bioinformatics. 2009, 10.

Lu-Jia Zhang, Tao Xu, Pei-Qing Yuan,Dong-Zhi Wei. Optimizing strategies research on the later stage of protein structure model. Chemical Journal of Chinese Universities-Chinese. 2008, 29(5): 977-980.

Q. Wu, H. Xu, L. J. Zhang, J. Yao,P. Ouyang. Production, purification and properties of gamma-glutamyltranspeptidase from a newly isolated Bacillus subtilis NX-2. Journal of Molecular Catalysis B-Enzymatic. 2006, 43(1-4): 113-117.