張岩[哈醫大生物信息科學與技術學院教授]

張岩[哈醫大生物信息科學與技術學院教授]
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張岩,女,理學博士。現任哈醫大生物信息科學與技術學院教授。

人物經歷

2000年到日本留學深造,參加過多項日本文部省的課題,2003年獲得日本新瀉大學的碩士學位,2006年獲得新瀉大學的博士學位,同年被聘為哈爾濱醫科大學生物信息科學與技術學院的教授,多年來一直從事生物信息學和計算表觀遺傳學領域的教學和科研工作,取得了突出成績。職務:計算系統生物學教研室負責人。

主講課程

生物信息學進展,計算系統生物學導論,藥物與受體動力學,課題標書設計,醫用多因素分析等課程。

主要貢獻

張岩教授所帶領的計算表觀遺傳學課題組致力於表觀遺傳領域的高通量數據挖掘的算法和軟體開發,可視化網路平台及資料庫構建。研究方向涉及遺傳與表觀遺傳學元件的協同調控研究,構建表觀遺傳網路探討表觀遺傳修飾在人類重大疾病發生髮展中的作用,結合功能基因組學將生物信息學套用在癌症表觀遺傳學,幹細胞表觀遺傳學的研究中等。已經開發了差異甲基化區域篩選方法QDMR、人類組蛋白修飾資料庫HHMD、功能CpG島預測CpG_MI、識別乳腺癌超甲基化基因、全基因組甲基化位點預測及分析、發現組蛋白修飾組合模式的方法、繪製酵母基因組核小體動態圖譜、印記基因預測等軟體和資料庫平台。

科研成果在SCI、EI檢索期刊及核心期刊發表論文20餘篇,SCI收錄9篇,其中差異甲基化區域篩選方法QDMR、探測基因組範圍的功能CpG島方法CpG_MI和首次開發的人類組蛋白修飾資料庫HHMD三項成果發表在2010和2011年的《 Nucleic Acids Research》(SCI IF:7.479)。課題組在計算表觀遺傳學及表觀基因組學研究領域已經走在了國際前沿。目前主持1項國家自然科學基金面上項目,5項省市廳級課題,以項目骨幹參加973前期一項。作為編委參與編寫衛生部八年制規劃教材《生物信息學》。現任黑龍江生物醫學工程學會理事。

王金龍, 蘇建忠, 王芳, 崔穎, 張岩*: 基於模糊理論預測CpG島新方法. 生物信息學 2009, 7(2):91-94.

何成軍, 張瑞敏, 蘇建忠, 王芳, 張岩*: 血紅蛋白結構與及其攜氧功能的軟體平台開發. 生物信息學 2009, 7(3):91-94.

王芳, 蘇建忠, 崔穎, 張岩*: 醫學院校醫用高等數學教學方法的探討. 數理醫藥學雜誌 2009, 22(5):609-610.

王芳, 張岩*: 線性脈衝馬爾可夫調製隨機微分方程的漸進穩定性. 學問 2009, 17:3.

張岩, 今井清博, 小林道頼: 哺乳類ヘモグロビンの酸素輸送能とボーア効果は協調して酸素の獲得と輸送を行っている ―規範タンパク質に於ける新たな視點. 日本生物物理 2007, 47:58-66.

陳崇岩, 劉洪波, 張岩*: 三種不同方法預測和分析人類,小鼠和斑馬魚CpG島. 哈爾濱醫科大學學報 2011, (七年制專刊):(出版中).

楊嬌楠, 張岩*, 呂傑: 肺癌超甲基化基因的基因組特徵挖掘. 哈爾濱醫科大學學報 2008, (七年制專刊).

李博, 呂傑, 張岩*: 解析鐮刀狀細胞性貧血血紅蛋白的變異. 哈爾濱醫科大學學報 2007, (七年制專刊).

李逸文, 呂傑, 張岩*: 運用生物信息學的方法對斑馬魚胎兒血紅蛋白的初步分析. 哈爾濱醫科大學學報 2007, (七年制專刊).

主持完成和正在進行的科研項目

1、融合高通量信息的癌症表觀遺傳異常的特徵提取技術(61075023),國家自然科學基金面上項目,38萬元,2011.01-2013.12。

2、整合遺傳與表觀遺傳的高通量數據譜識別癌症表觀遺傳異常的特徵(C201012),黑龍江省自然科學基金面上項目,5萬元,2011.01-2013.12。

3、血紅蛋白有效輸送氧氣的機理解析及其生物學平台建立(D2007-35), 黑龍江省自然科學基金面上項目,4萬元,2008.01-2010.12。

4、血紅蛋白的系統生物學研究及構建其生物學平台(RC2007LX003004),哈爾濱市科技局,3萬元,2008.01-2010.12。

5、利用數學模型研究血紅蛋白有效輸送氧氣的機理(1152hq28),黑龍江省教育廳,4萬元,2007.01-2009.12。

6、哺乳動物血紅蛋白的協同作用和Bohr效應對有效輸送氧氣的意義及環境適應性的研究,國家教育部, 2.5萬元,2007.01-2009.12。

7、血紅蛋白攜氧機制的生物學研究,哈爾濱醫科大學科研啟動基金,5萬元,2006.05-2008.01。

著 作:

衛生部八年制規劃教教材《生物信息學》編委。

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