廣東省總隊附屬男科醫院擁有一批設施完善的實驗室和科研基地,目前擁有兩個藥物開發中心、一個國家新藥臨床實驗基地、三個衛生部重點醫療實驗室、是第二軍醫大學、第三軍醫大學、中國醫科大學等著名高等院校的教學醫院和臨床研究部,這為醫院提供了強大的科研支撐,也確保了廣東省總隊附屬男科醫院的科研力量居於醫學技術的前沿位置。
廣東省總隊附屬男科醫院主要從事藥品、醫療器械的研究、生產、技術轉讓和推廣,並獲得國家多項“科技進步獎”。醫院已六次榮獲“全國衛生系統先進集體”稱號。其主治性功能障礙的專用藥非洲小紅燕精膠囊獲得國家科技成果獎,並已在全國推廣套用。廣東省總隊附屬男科醫院憑藉出色的科研設施和出眾的科研實力已處於我國男科醫院的領導地位。
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