婚姻經歷
畫像作於1619年，作者不明雖然兄長並不支持，瑪麗亞·埃利奧諾拉還是在1620年帶著母親的許可嫁給了瑞典國王古斯塔夫二世·阿道夫。1626年她生下了唯一倖存的孩子——女兒克里斯蒂娜，這位公主日後成為了聞名歐洲的瑞典的克里斯蒂娜女王。瑪麗亞·埃莉奧諾拉由於性格上的缺陷，在丈夫去世後完全情緒失控，進而導致精神失常，她因此被剝奪了對唯一女兒的撫養權。這位瑞典王后在流放與漂泊中度過了悽慘的後半生。
她曾被描述為歐洲最美的王后，而她的女兒則這樣說：“她有所有（女性）所能擁有的美與惡。”
父母不和
瑪麗亞·埃莉奧諾拉的父親約翰·西格斯蒙德是一個懶惰的酒鬼，經常大吃大喝。由於過於肥胖，他經常呼吸困難；患了痛風之後，他的行動更加受限。不過作為君主他的任期還算風平浪靜。1614年他頒布了一項“寬容令”以維護宗教信仰自由。他自己由路德教改信加爾文宗，但允許了他的妻子和孩子保留他們的路德教信仰。瑪麗亞·埃莉奧諾拉的母親——普魯士的安娜，則與懶惰的丈夫相反，是個有主見而充滿活力的女人。這對霍亨索倫夫婦爭吵的時候，經常摔盤碎碗。安娜的妹夫、薩克森選帝侯約翰·喬治一世曾寫信給約翰·西格斯蒙德說，若是他的妻子膽敢那樣惹惱自己，他一定會打她。
未來夫婿
古斯塔夫二世·阿道夫從1613年開始，古斯塔夫二世·阿道夫熱戀一位瑞典宮廷里的貴族女子艾芭·布拉赫，他曾試圖向母親霍爾斯坦-戈托普的克里斯蒂娜尋求與布拉赫結婚的許可但被拒絕。雖然他從此放棄了與其結婚的想法，但他一直愛著這位女士。1616年，22歲的瑞典國王開始尋找可能的信奉新教的新娘人選，那時他聽到了關於17歲的瑪麗亞·埃莉奧諾拉美貌與品質的各種極盡讚美。約翰·希赫斯蒙德選帝侯很青睞他，但他在1617年秋季的一次中風之後變得非常虛弱，而他意志堅決的普魯士妻子卻非常不喜歡這位瑞典國王。因此時普魯士尚為波蘭采邑，波蘭國王一直因為把瑞典輸給古斯塔夫·阿道夫的父親而懷恨在心。
此外，瑪麗亞·埃莉奧諾拉還有很多其他的追求者，包括奧蘭治的威廉、波蘭的瓦拉吉斯拉·瓦薩、梅克倫堡的阿道夫·弗雷德里希，甚至還有英格蘭的威爾斯王子 。
母親——普魯士的安娜女公爵瑪麗亞·埃莉奧諾拉的哥哥喬治·威廉很滿意於英國王儲的求婚，於是建議瑞典國王娶他們更小的妹妹卡塔琳娜為妻，然而瑪麗亞·埃莉奧諾拉本人卻很中意古斯塔夫·阿道夫。而對於古斯塔夫來說，能否娶到布蘭登堡的公主只不過是一件關乎自己榮譽的事而已。他把斯德哥爾摩城堡的房間裝飾一新，並準備親赴柏林以進一步追求瑪麗亞·埃莉奧諾拉，但此時未來的岳母安娜女公爵忽然寄書信一封給古斯塔夫的母親。信中布蘭登堡選帝侯夫人直截了當地請求瑞典王太后阻止自己兒子前往柏林的行程，因為“瑞典和波蘭間的戰事形勢並不利於布蘭登堡的利益”，而他的丈夫“因判斷力受病情影響，可以應允一切事情，即使那會使國家分崩離析。”這封措辭冷淡的拒絕信幾乎可看作是一次對瑞典王室的羞辱。
終成伴侶
1619年12月23日，約翰·西格斯蒙德選帝侯去世，似乎與瑞典聯姻的最後一絲可能也因此不復存在了。但固執的古斯塔夫依然在1620年春天到達了柏林。安娜女公爵的態度依然非常保守，甚至拒絕了古斯塔夫與瑪麗亞·埃莉奧諾拉單獨會見的請求，然而所有在場的人都注意到了公主對年輕國王的愛慕。這之後，古斯塔夫逐個訪問了信奉新教的德國宮廷，試圖尋找其他可能的聯姻對象 。而當他再次返回柏林時，安娜女公爵一改以往的態度，竟喜歡上了這個很有魅力的年輕人。古斯塔夫於是向瑪麗亞·埃莉奧諾拉交託了自己的誓言，之後就匆忙返回瑞典準備迎接自己的新娘。
瑪麗亞·埃莉奧諾拉的哥哥，即新任選帝侯喬治·威廉，在普魯士聽聞母親的獨斷決定後大為驚駭。他寫信給古斯塔夫·阿道夫說，除非瑞典和波蘭能解決兩國間的分歧，否則他是不會同意這次聯姻的。然而，就像霍亨索倫王朝一貫的傳統那樣，最終還是安娜女公爵敲定了女兒的婚事。她把瑪麗亞·埃莉奧諾拉送到喬治·威廉勢力範圍之外的布倫瑞克 ，並獨自一人完成了聯姻的談判。
瑪麗亞·埃莉奧諾拉，作者不詳在從國庫里挑選了部分珍寶後，普魯士的安娜即前往布倫瑞克與女兒會合。在那裡母女倆搭乘瑞典艦隊的船隻到達卡爾馬，瑞典國王早已在此等候多時。1620年11月25日，古斯塔夫二世·阿道夫和瑪麗亞·埃莉奧諾拉舉行婚禮，在婚宴上表演了一出改編自中世紀瑞典國王Olof Skötkonung經歷的戲劇。這次終成的婚姻，用古斯塔夫·阿道夫自己的話來說，就是“婚床上終於有了一位布蘭登堡的女士” 。
古斯塔夫·阿道夫和瑪麗亞·埃莉奧諾拉在建築和音樂方面有著相似的欣賞品位，而新王后更是全身心地愛著自己的丈夫。外國大使都稱讚王后美麗和藹、品位高雅，雖然她在性格上已顯露出某些極端的傾向。瑪麗亞·埃莉奧諾拉極喜娛樂活動和甜食，不久就沉迷於當時流行的宮廷丑角和侏儒。她可以流利地說法語——當時的通用宮廷語言，但卻不怎么在意能否正確地書寫德文或瑞典文。
新婚後六個月，古斯塔夫·阿道夫啟程指揮對里加的圍困，此時瑪麗亞·埃莉奧諾拉已經懷孕。她只與自己的德國宮廷女官為伴，與周遭的瑞典人很難融入。她不習慣瑞典的鄉下和天氣 ，也不喜歡糟糕的路況、陰沉的森林或是以草覆頂的木製房屋。王后強烈地思念自己的丈夫，而她在婚後一年時流產並患了重病。此後的瑪麗亞·埃莉奧諾拉變得易怒、極端、神經質且善妒。她經常不假思索地講話，而且總也不離開丈夫的身邊，無論是否有客人在場。她的情感生活徹底失去了平衡，因此每一件她自發決定做的事情都需要很小心地監督。不久古斯塔夫·阿道夫就意識到自己的新婚妻子將成為憂慮與哀痛的緣由。
瑪麗亞·埃莉奧諾拉的紋章不過瑪麗亞·埃莉奧諾拉對丈夫的感情是出於真愛，這在當時的王室夫妻中並不常見。從某種程度上來說，背著兄長嫁給古斯塔夫·阿道夫的行為可說是私奔，這帶有些許浪漫意味的婚姻也許是讓瑪麗亞·埃莉奧諾拉萌生愛意的原因。她非常公開地表達對丈夫的愛，而這在當時是不符合王后身份的不恰當的行為。人們因此認為她情緒激動、有歇斯底里傾向並且很“女性化”——意指沒什麼頭腦的女性。古斯塔夫·阿道夫也曾下旨，如果他去世時繼承人尚未成人，他的孀妻不可以與政事有絲毫的關聯。實際上，國王在結婚後也一直都愛著舊情人艾芭·布拉赫，但瑪麗亞·埃莉奧諾拉似乎從未注意到此事。1623年瑪麗亞·埃利奧諾拉產下一女，但第二年女嬰便夭亡了。在當時的情況下，瑞典王位的繼承人就只有那可憎的波蘭國王及其子孫，而古斯塔夫·阿道夫又經常在戰場上出生入死，因此瑞典的王位繼承人成為了人們極為憂慮的問題。第二年秋天王后第三次懷孕，被抱以極大期待。1625年5月，她的精神狀態極好，堅持要和丈夫一起登上皇家帆船檢閱海軍。戰艦就停泊在王宮對面，一切看似毫無危險，但是一陣突來的暴風雨幾乎掀翻了國王夫婦乘坐的帆船。王后被立刻送回宮裡，但她回到宮中時忽然大喊：“耶穌啊，我感覺不到我的孩子了！”不一會兒，瑪麗亞·埃莉奧諾拉死產一胎——那即是被渴望的、可繼承王位的一個男孩。
三女降生
女兒——瑞典的克里斯蒂娜女王瑞典和波蘭再度開戰，古斯塔夫·阿道夫不得已又離開了妻子。瑪麗亞·埃莉奧諾拉極有可能陷入了歇斯底里式的悲傷——在1627年她產生過這樣的情緒波動，見下文——這也許是為什麼古斯塔夫·阿道夫在1626年1月擊敗波蘭人時，準許王后來利沃尼亞與自己相會。4月，瑪麗亞·埃莉奧諾拉發現自己再次懷孕。這一次她再也不敢冒險做可能傷及腹中孩子的事情，而占星學家的預測是個男孩。在戰爭的間歇，古斯塔夫·阿道夫匆忙趕回了斯德哥爾摩等待自己孩子的降生。生產相當艱難，12月7日，一個被羊膜包裹的嬰兒被平安誕下，只有頭、胳膊和膝蓋以下的腿部露出來。再加之新生兒的鼻子很大而且毛髮濃密，這個孩子立刻被認為是男孩，國王也是如此被告知的。然而當人們仔細觀察的時候才發現，新生兒是個女孩。古斯塔夫的同父異母姐姐——瑞典的凱薩琳公主於是抱著女嬰給古斯塔夫看，“以便國王能明白她不敢說出來的事情”。古斯塔夫意識到是空歡喜一場後不無詼諧地說：“她一定會很聰明的，看她把我們所有人都愚弄了。 ”他並沒有失望太久，並以自己母親的名字給女兒命名為克里斯蒂娜，然后庄嚴地宣告了女兒的降生，而通常只有男性繼承人出生時才會這樣做。這似乎說明三十三歲的古斯塔夫·阿道夫已意識到自己不太可能再擁有其他子嗣了，最可能的原因是瑪麗亞·埃莉奧諾拉的健康惡化，雖然此後的畫像和她的行為並沒有表現出任何重大病症的跡象。
剛剛生產後的瑪麗亞·埃莉奧諾拉顯然不適合聽到這個尷尬的訊息，國王和宮廷在好幾天后才告訴她嬰兒被錯認成男孩。她當時大喊說：“不是男孩而是生下了一個女孩嗎，一個又黑又醜、長著大鼻子和黑眼睛的女孩！把她從我身邊帶走，我不想要這樣一個怪物！”瑪麗亞·埃莉奧諾拉很可能得了產後憂鬱症，她發瘋的時候甚至試圖傷害自己的孩子。大概母親的厭惡帶來了詛咒，童年時代的克里斯蒂娜不斷發生各種意外：搖籃上方的一根橫樑曾莫名其妙地墜落，長大之後她曾有一次意外滑落樓梯，而她還是個嬰兒的時候被保姆不下心掉在了石頭地板上摔傷了肩骨，結果她的一側肩膀終生傾斜。
7歲的克里斯蒂娜，Jacob Heinrich Elbfas繪克里斯蒂娜出生後一年，瑪麗亞·埃莉奧諾拉由於丈夫的離開陷入了嚴重的歇斯底里狀態。1632年時古斯塔夫·阿道夫曾將自己的妻子描述為“一個病重的女人”。不過王后也並不是無端地情緒失控，各種精神上的刺激諸如流（死）產三次、無法融入新的祖國，更加雪上加霜的是1627年以後她的兄長加入了瑞典的敵對陣營，這更讓瑪麗亞·埃莉奧諾拉覺得身處一個充滿敵意的地方。同時，常年征戰的她的丈夫總是生死難料：1627年古斯塔夫·阿道夫曾在患病情況下負傷，兩年後在什圖姆（今波蘭境內）的脫險更是千鈞一髮。然而國王對於新生的女兒非常喜愛，全身心地投入到對公主的教育和培養中。他一直想把克里斯蒂娜當成男孩養大。兩歲時，年幼的公主在聽到卡爾馬城堡巨大的皇家禮炮聲後高興地拍手笑了起來，此後古斯塔夫·阿道夫就經常帶女兒參加軍事檢閱。瑪麗亞·埃莉奧諾拉對於女兒十分冷淡，同時她也不被允許對女兒的成長施加絲毫的影響：照料公主的人是國王的同父異母姐姐凱薩琳和最高總理大臣阿克塞爾·奧克森謝納。克里斯蒂娜對母親也毫無親情可言，大概因為肩膀稍微畸形的緣故，她對母親喜愛的侏儒和小丑非常厭惡。
呂岑戰役中的古斯塔夫二世·阿道夫1630年，古斯塔夫·阿道夫認為哈布斯堡王朝試圖建立波羅的海霸權的陰謀嚴重威脅到了瑞典的生存及其宗教自由，他決定參加三十年戰爭以對抗哈布斯堡。在出發前，國王曾和政府要員討論過可能的攝政統治。在會上古斯塔夫·阿道夫自己也承認了妻子是個“不幸的女人”，但要他自己把妻子從攝政委員會的名單中剔除也讓他很難做到。他對阿克塞爾·奧克森謝納坦白說：“如果我發生任何不測，請您務必憐憫、照顧我的家人[...]，那個母親缺乏常識性的判斷，而女兒又是個孩子——如果她們掌政，那會是令人絕望的；如果她們成為了別人的傀儡，那將成為危機。”
王后孀居
在這之後的兩年，古斯塔夫·阿道夫在德意志滿目瘡痍的土地上不斷征戰，先後攻下波美拉尼亞和梅克倫堡。11月初他趕至愛爾福特，與去年冬天起就暫居德國的王后道別。呂岑戰役中，三十九歲的古斯塔夫二世·阿道夫背後中了一槍，他從馬上墜下並在地上被拖拽了一段距離。他成功地擺脫了馬鐙的束縛，但當他躺在地上的時候，這位有“北方雄獅”之綽號的君主被第二發正中頭顱的子彈結束了生命。傍晚時雙方軍隊都已疲憊不堪，但薩克森-魏瑪的伯納德和瑞典軍捕獲了全部的帝國炮兵並已搶占了戰場的關鍵位置。國王的屍體終於被找到，古斯塔夫·阿道夫臉朝下躺在戰場的泥土中，身上的穿戴除襯衫外以被洗劫一空。
丈夫去世後的瑪麗亞·埃莉奧諾拉1633年瑪麗亞·埃莉奧諾拉帶著丈夫的棺柩返回了瑞典。在尼雪平，七歲的克里斯蒂娜在莊嚴的佇列行進中迎接了搭有父親遺體的船隻。這位未來的女王曾寫道：“我擁抱了母后，她的眼淚幾乎將我淹沒，而她的懷抱簡直讓我透不過氣來。”瑪麗亞·埃莉奧諾拉因心愛丈夫的死完全崩潰，在這之後一年多的時間裡，她強迫女兒與世隔絕為父親服喪，房間用黑布完全覆蓋，陽光無法進入而僅以燭光照明。她還和女兒睡在一起，床上懸掛著放置了古斯塔夫·阿道夫心臟的金匣。而瑪麗亞·埃莉奧諾拉時常爆發的哭泣更是讓人無法忍受。終於王后病倒了，她的左胸上起了潰瘍，造成了巨大的疼痛和高燒。1634年夏天國王終於被下葬，克里斯蒂娜女王后來寫道：“她（瑪麗亞·埃莉奧諾拉）的服喪簡直做到了完美。”
此後的王后完全不控制自己的情緒，長時間地浸淫在無節制的哀傷里。她覺得此時的瑞典比任何時候都要讓她厭惡——“岩石和山嶽，冰冷刺骨的空氣，以及其他所有的一切”。一直到生命結束，瑪麗亞·埃莉奧諾拉都在悽慘地回憶著丈夫英雄一樣的身影，她時常連續好幾個小時地哭泣，有時甚至長達幾天。最終攝政委員會將克里斯蒂娜公主從她身邊帶走，王后痛苦地抗議，但一切於事無補。
漂泊生涯
格里普斯科爾摩城堡1636年，瑪麗亞·埃莉奧諾拉已經完全精神失常，她被遣送到格里普斯科爾摩城堡，正式失去了對女兒的監護權。1639年，一封由她寫給瑞典宿敵——丹麥的信件被截獲。在被傳喚後，1640年夏天瑪麗亞·埃莉奧諾拉淚如雨下出現在女兒斯德哥爾摩的宮廷。當時年十三歲的克里斯蒂娜女王與母親理論，希望她不要去靠近丹麥的尼雪平定居。之後瑪麗亞·埃莉奧諾拉便返回了格里普斯科爾摩城堡。她聲稱為了齋戒而把自己關在套間裡，僅有一個宮廷女官與她做伴。當夜兩人從窗逃離了城堡，劃一條小船渡過了附近的一個湖，在對岸登上一輛事先備好的馬車。她們一路到了尼雪平，並在那裡登上一條駛向丹麥的船。丹麥國王克里斯蒂安四世本授意將她直接送回故鄉布蘭登堡，但瑪麗亞·埃莉奧諾拉設法說服船長將她帶到了丹麥。
在丹麥，瑪麗亞·埃莉奧諾拉成為了克里斯蒂安四世的座上賓，而哥哥喬治·威廉——布蘭登堡的選帝侯卻禁止妹妹返鄉。她不得不一直等到當年12月哥哥去世、她的侄子允許她回到布蘭登堡，但新選帝侯要求瑞典必須支付姑母的贍養金。瑪麗亞·埃莉奧諾拉最終收到了一小筆每年三萬埃居的生活費。然而不可思議的是，不久以後她開始思念瑞典。1648年她回到了她的第二祖國，克里斯蒂娜前去迎接母親的船。由於被風暴延誤，年輕的女王露天睡了兩夜，還因此發了燒，臥床休息了好幾天。1650年10月，瑪麗亞·埃莉奧諾拉自豪地出席了女兒延期舉行的加冕禮。
王后崩逝
瑪麗亞·埃莉奧諾拉的棺柩1654年初，克里斯蒂娜女王做出了震驚所有人的決定：轉信天主教並將王位讓給表兄卡爾·古斯塔夫（即之後的卡爾十世） 。瑪麗亞·埃莉奧諾拉對於女兒的行為完全不能理解，並對此事將給自己財政情況造成的可能影響非常擔憂。四月，卡爾和克里斯蒂娜表兄妹一起去尼雪平拜訪了她，並寬慰她不需要為任何事擔心。於是瑪麗亞·埃莉奧諾拉見證了自己女兒的退位，但一直嘆惋女兒不明智的決定。一年之後，瑪麗亞·埃莉奧諾拉病逝，此時他的女兒、前瑞典女王克里斯蒂娜正身著男裝，在歐洲各國浪跡天涯。
她被葬在瑞典王室教堂——騎士島教堂。
