藩史
戰國時代是有馬氏的領地，關原之戰後支持德川軍保住了領地。1614年移遷到延岡藩。期間成為了天領，1616年由松倉氏入主，對領內的基督教徒鎮壓，加上實行暴政，導致了島原之亂的原因。松倉氏因而被處罰。並由高力氏入主。後來經戶田、松平氏管治。廢藩置縣後，成為島原縣，然後被篇入為長崎縣。
歷代藩主
有馬家
4萬石 外樣 （1600年～1614年）
晴信
直純
天領
1614-1616年
松倉家
4萬石 外樣 （1616年～1638年）
重政
勝家
高力家
4萬石 譜代 （1638年～1668年）
忠房
隆長
深溝松平家
6萬5000石 譜代 （1668年～1747年）
忠房
忠雄
忠俔
忠刻
忠祗
戶田家
7萬7000石 譜代 （1747年～1774年）
忠盈
忠寛
深溝松平家
6萬5000石 譜代 （1774年～1871年）
忠恕
忠馮
忠侯
忠誠
忠精
忠淳
忠愛
忠和
