導水管周圍灰質的構造：
根據細胞構築特點．一般可分為內、外和背側三個亞核：（1）內側亞核，為中腦中央灰質的最內側，緊挨中腦水管膠狀層，由散在少量的小梭形細胞組成；（2）外側亞核，位於內側亞核的背外側，是中央灰質的最外側部分，由中小型密集的橢圓形、梭形或三角形細胞組成，偶見大型細胞；（3）背側亞核，位於中腦水管和外側亞核的背側．為一小卵圓形區，其中有密集的膠質核，偶見小型深染神經元。接受來自下丘腦、腦幹網狀結構、中縫核、藍斑和脊髓的傳人纖維，發出纖維至下丘腦、丘腦、腦幹網狀結構、中縫核和脊髓等。其神經元對腦啡肽、P物質、腸促胰酶肽、5羥色胺、神經緊張素、強啡肽、生長激素釋放抑制因子免疫反應陽性，往往一個神經元含幾種神經肽。與中樞鎮痛機理、生殖、攻擊行為的控制等有關。
解剖結構：
1、中腦：
中腦是腦六個部分中最小的部分，仍保持神經管的原始形態，長約15～20毫米，位於腦橋和間腦之間。中腦腹側面上界為視束，下界為腦橋上緣；腹側面兩側有粗大的縱行纖維構成的隆起，稱大腦腳；在左右大腦腳之間的凹陷處，稱腳間窩，動眼神經根自窩的外緣出腦；背側面(又稱頂蓋)有四疊體，由兩對小圓丘組成，上一對稱上丘，是視覺皮質下中樞，它借上丘臂(為白質纖維)與外側膝狀體聯繫；下一對稱下丘，是聽覺皮質下中樞，它借下丘臂(為白質纖維)與內側膝狀體聯繫。在下丘的下方有滑車神經穿出。中腦內有中腦水管，上通第三腦室，下通第四腦室。
在中腦橫切面背側部中央，有中腦水管的斷面，中腦水管的周圍有一層灰質，稱中央灰質。灰質的背側是四疊體。中腦的腹側即大腦腳，每側大腦腳被一層含黑色素的神經細胞(即黑質)分為二部：黑質的背側部，稱被蓋，其中含有網狀結構，向下與腦橋的網狀結構相連；黑質的腹側部，是一層很厚的神經纖維板，稱為腳底。
被蓋，由灰質和白質組成。被蓋的中央部有細胞體堆聚構成的紅核，此核是皮質下運動中樞，細胞突相互交叉，並構成紅核脊髓束。在紅核的外側有傳導本體感覺和皮膚感覺的上行纖維，將這些纖維統稱為內側丘系，行向丘腦。內側丘系與紅核之間的間隙，稱中腦網狀結構，其背側有中央灰質。中腦水管在中央灰質中通過。在中腦水管的底上，有動眼神經核和滑車神經核，前者位於上丘平面內，後者位於下丘平面內。在動眼神經核的內側有達克謝維奇氏核，此核中的細胞發出的突起形成內側縱束，行入脊髓。
2、第三腦室：
第三腦室位於兩間腦之間的矢狀窄裂，前部向前以室間孔與左右側腦室相通，向後以中腦水管與第四腦室相通。第三腦室分為頂、底、前、後壁和兩側壁。
頂：由緊張於丘腦帶間的腦室膜和復蓋其上的軟腦膜連合而成。稱此部軟膜為第三腦室脈絡組織，其中有兩條脈絡叢突入第三腦室。第三腦室脈絡叢向前，到室間孔移行於左右側腦室脈絡叢。
底：斜向前下方，主要由下丘腦組成。室腔向下，延伸入漏斗，形成漏斗隱窩。
前壁：下部由終板構成，上部由穹窿柱和前連合構成。前壁與頂壁連線處的後方有室間孔。
後壁：由松果體和後連合構成。
側壁：上部由丘腦內側面前2/3構成，下部由下丘腦構成，兩側壁之間有中間塊相連線。
