學院教學科研體系完善，師資力量雄厚。現設有基礎獸醫學系、臨床獸醫學系、預防獸醫學系、動物生物技術系、動物遺傳育種與繁殖系、動物營養與飼料科學系等6個教學單位；設有動物機能與形態學研究室、動物營養代謝病與中毒病研究室，動物重要病原與疫病研究室、動物生物技術研究室、動物遺傳繁育工程研究室和人獸共患病研究所等6個科研單位；設有動物疾病診斷與防治中心、動物繁育與飼料研發中心、動物科技實驗教學中心等3個實習、實驗基地。擁有教師87人，其中教授32人，副教授25人，博士生導師41人（兼職9人），碩士生導師29人(兼職9人)，12人在國家級學會及專業委員會任副理事長以上學術職務，31人享受國務院特殊津貼，先後培養2名中國工程院院士。
學院現開設動物醫學、動物科學、生物技術3個本科專業；動物藥學、寵物醫學、實驗動物學、獸醫公共衛生學、動物生物技術、生物製藥等6個專業方向。動物醫學專業是學院的品牌專業，獸醫學科處於國內領先水平和國際先進水平。2004年國家一級學科水平評估列第五名，學院從20世紀五十年代就開始培養研究生，是全國首批博士、碩士學位授權單位。學院現有1個國家重點學科(預防獸醫學)；2個博士後科研工作流動站(獸醫學、生物化學與分子生物學)；5個博士學位授權學科(生物化學與分子生物學、基礎獸醫學、預防獸醫學、臨床獸醫學、動物遺傳育種與繁殖學)；9個碩士學位授權學科(動物學、微生物學、生物化學與分子生物學、動物遺傳育種與繁殖、動物營養與飼料科學、基礎獸醫學、預防獸醫學、臨床獸醫學、軍事預防醫學)。1978年以來，學院共獲各類教學科研成果獎340餘項。目前，承擔國家自然科學基金重點課題 、國家攻關課題、“863”、“973”課題、歐盟框架、中法先進計畫及省部級科研項目70餘項。
學院堅持開放辦學，注重國際交流，先後同日本、美國、法國、丹麥、瑞典、德國、紐西蘭等20多個國家的院校、科研機構保持密切的學術聯繫。與日本北里大學簽訂協定，定期互派訪問學者和留學生。
吉林大學畜牧獸醫學院將立足國家科技知識創新體系的需求，充分發揮學科專業、人才培養、科學研究、師資隊伍的優勢和特色，努力使學科整體達到國內先進水平，重點學科接近或達到國際領先水平，成為國家高質量創新人才培養、高水平科學技術研究和成果轉化的重要基地，以實現“創建國內高水平研究型畜牧獸醫學院”的宏偉目標。
