歷史沿革
1955年12月，《東北人民大學自然科學學報》創刊。
1958年，《東北人民大學自然科學學報》隨學校名改為《吉林大學自然科學學報》。
1963年，刊期由半年刊改為季刊。
1966年，《吉林大學自然科學學報》因“文革”停刊。
1973年，經國務院批准復刊，名為《吉林大學學報（自然科學版）》。
1979年，經教育部科技委員會批准對外發行，恢復使用刊名《吉林大學自然科學學報》。
2002年，《吉林大學自然科學學報》更名為《吉林大學學報（理學版）》。
2005年，刊期改為雙月刊。
2014年12月，入選國家新聞出版廣電總局第一批認定學術期刊。
辦刊條件
欄目方向
《吉林大學學報（理學版）》以研究論文、研究快報、研究簡報和綜合評述等形式報導吉林大學自然科學領域（其中包括數學、物理學、化學、生命科學、計算機科學以及與其相關的學科）的基礎研究、套用研究和開發研究中所取得的創新性研究成果，同時還適當刊登中國國內外其他高等院校和科研院所在上述學科領域研究中所取得的優秀研究成果。
人員編制
截至2009年6月，《吉林大學學報（理學版）》編輯部有編輯4人，設主編1人、常務副總編1人。該刊編輯委員會（2011-2014年）有委員45人、特聘委員4人、國際編委4人，設主任委員1人、副主任委員7人。
| 姓名 | 負責內容 |
| 趙立芹 | 主要負責數學類稿件的管理及編輯出版工作 |
| 王健 | 主要負責物理、電子和材料科學稿件的管理及編輯出版工作 |
| 韓嘯 | 主要負責計算機稿件的管理及編輯出版工作，同時負責網刊及網站維護和管理 |
| 單凝 | 主要負責化學、生物學和環境科學稿件的管理及編輯出版工作 |
| 職務 | 姓名 | ||||||||
| 委員 | 丁大軍 | 於文學 | 于吉紅 | 於哲舟 | 馬英君 | 孔維 | 王洪艷 | 王恩思 | 王德軍 |
| 王德輝 | 馮守華 | 付學奇 | 母瀛 | 呂天全 | 閆羽 | 紀友清 | 劉忠英 | 劉磊 | |
| 孫洪波 | 杜現昆 | 李文輝 | 李正強 | 李永海 | 李勇 | 吳柏生 | 鄒永魁 | 陳崗 | |
| 楊柏 | 張漢壯 | 張樹功 | 張寒琦 | 歐陽丹彤 | 周慧 | 鄭偉濤 | 房學迅 | 趙立芹 | |
| 胡亮 | 徐淮良 | 高文杰 | 郭樹旭 | 崔田 | 裘式綸 | 蔡勇 | 潘洪玉 | 戴振文 | |
| 特聘委員 | 孫家鍾、沈家驄、鄒廣田、徐如人 | ||||||||
| 國際編委 | 申澤驤、蘇寶連、楊宏戟、歐陽天成 | ||||||||
辦刊成果
出版發行
據2019年2月22日中國知網顯示，《吉林大學學報（理學版）》共出版文獻6833篇。
據2019年2月22日萬方數據知識服務平台顯示，《吉林大學學報（理學版）》共載文4073篇，基金論文3424篇。
年度總文獻量（據2019年2月22日中國知網顯示）收錄情況
截至2018年11月，《吉林大學學報（理學版）》被中國國內外20多種著名資料庫和文摘刊物收錄和摘引，是CSCD中國科學引文資料庫來源期刊（2017-2018年度）（含擴展版）、北京大學《中文核心期刊要目總覽》來源期刊（1992年（第一版）、1996年（第二版）、2000年版、2004年版、2008年版、2011年版、2014年版、2017年版）、中國科技論文統計源期刊，被中國學術期刊綜合評價資料庫、中國期刊全文資料庫、中國核心期刊（遴選）資料庫、中國數學文摘及中國數學文獻資料庫、電子科技文摘及其資料庫、中國化學化工文摘及其資料庫、中國生物學文摘及中國生物學文獻資料庫、重慶維普中文科技期刊資料庫、中國學術期刊文摘、中國科技論文線上、中國知網、萬方資料庫、國際龍源期刊網、台灣華藝資料庫、博看網、教育閱讀網、超星數字期刊網、CA《化學文摘》（美）（2014）、SA《科學文摘》（英）（2011）、Pж（AJ）《文摘雜誌》（俄）（2014）、《數學評論》（MR）（美）、《數學文摘》（Zbl Math）（德）、《劍橋科學文摘：材料信息》（CSA：MI）（美）等收錄。
影響因子
據2008年—2013年中國科學技術信息研究所編輯的《中國科技期刊引證報告（核心版）》顯示，《吉林大學學報（理學版）》影響因子2007年為0.550、2008為0.376、2009為0.401、2010為0.492、2011為0.368、2012為0.342。
據2019年2月22日中國知網顯示，《吉林大學學報（理學版）》總被下載601641次、總被引25862次、（2018版）複合影響因子為0.599、（2018版）綜合影響因子為0.450。
據2019年2月22日萬方數據知識服務平台顯示，《吉林大學學報（理學版）》被引量為14248、下載量為93771；據2015年中國期刊引證報告（擴刊版）來源數據顯示，該刊影響因子為0.46，在全部統計源期刊（6735種）中排第3122名、在大學學報（自然科學）（269種）中排第92名。
榮譽表彰
截至2018年11月，《吉林大學學報（理學版）》在吉林省、教育部及全國優秀科技期刊評比中共獲獎20多次，其中獲吉林省優秀科技期刊一等獎和十佳期刊6次，全國優秀科技期刊評比二等獎2次，2次被評為“中國精品科技期刊”，多次獲教育部科技發展中心“中國科技論文線上優秀期刊”一等獎和二等獎。
| 獲獎年份 | 獎項名稱 |
| 2012年 | 教育部中國科技論文線上優秀期刊二等獎 |
| 2011年 | 教育部中國科技論文線上優秀期刊二等獎 |
| 2011年 | 中國精品科技期刊 |
| 2010年 | 第三屆中國高校優秀科技期刊獎 |
| 2009年 | 全國高校科技期刊優秀編輯質量獎 |
| 2009年 | 教育部科技發展中心《中國科技論文線上》優秀期刊一等獎 |
| 2009年 | 被吉林省新聞出版局評為自然科學類“吉林名刊 |
| 2008年 | 中國學術期刊評價委員會“RCCSE中國權威學術期刊” |
| 2008年 | 中國精品科技期刊 |
| 2008年 | 第二屆中國高校優秀科技期刊 |
| 2008年 | 教育部科技發展中心《中國科技論文線上》優秀期刊一等獎 |
| 2007年 | 首屆吉林省高校科學研究促進獎 |
| 2006年 | 首屆中國高校優秀科技期刊 |
| 2005年 | 吉林省十佳科技期刊 |
| 2004年 | 全國高校優秀科技期刊評比二等獎 |
| 2001年 | 吉林省十佳期刊 |
| 2001年 | 中國期刊方陣（雙百期刊） |
| 2001年 | 《CAJ-CD規範》執行優秀獎 |
| 1999年 | 全國優秀高等學校自然科學學報及教育部優秀科技期刊評比”一等獎 |
| 1999年 | 吉林省自然科學十佳期刊 |
| 1997年 | 第二屆全國優秀科技期刊評比”二等獎 |
| 1997年 | 吉林省自然科學十佳期刊 |
| 1996年 | 國家教委系統優秀科技期刊一等獎 |
| 1995年 | 全國高等學校自然科學學報系統優秀學報評比一等獎 |
| 1995年 | 吉林省十佳期刊 |
| 1992年 | 國家教委直屬高校優秀科技期刊 |
| 1992年 | 全國優秀科技期刊評比二等獎 |
| 1992年 | 吉林省優秀科技期刊評比一等獎 |
| 2005年 | 高校科技期刊先進集體（中國高校自然學報研究會） |
| 2008年 | 高校科技期刊先進集體（中國高校自然學報研究會） |
文化傳統
《吉林大學學報（理學版）》以交流學術思想，推動科學研究，提高教學水平，繁榮中國科學文化事業，促進科教興國和學校發展的科學發展觀為辦刊宗旨；以新（選題新，發表成果創新性強）、快（編輯出版速度快）、高（刊文學術水平和編輯出版質量高）為辦刊特色。
期刊領導
現任領導
| 部門 | 職務 | 姓名 |
| 編輯部 | 主編 | 裘式綸 |
| 常務副總編 | 趙立芹 | |
| 編委會 | 主任委員 | 裘式綸 |
| 副主任委員 | 馮守華、孔維、孫洪波、陳崗、胡亮、趙立芹、高文杰 |
歷任領導
| 任職時間 | 姓名 | 職務 |
| 1955年12月 | 余瑞璜 | 《東北人民大學自然科學學報》主編 |
| 1958年 | 唐敖慶 | 《吉林大學自然科學學報》主編 |
| 1973年 | 唐敖慶 | 《吉林大學學報（自然科學版）》主編 |
| 1985年 | 伍卓群 | 《吉林大學自然科學學報》主編 |
| 2003年 | 裘式綸 | 《吉林大學學報（理學版）》主編 |
