化學社
化學社實驗照片南京市第一中學化學社是南京一中的重要的社團之一（詳見化學社詞條）。 化學社最早成立於2015年，2016年暫停招新，2017年又成功恢復，因而成為南京一中罕見的停招之後又成功復社的社團。
2016年沒有正式的化學社活動，但有幾名16級學生，以志願者身份提議恢復化學社，並參與了17級化學社招新等活動。他們原本分別來自和平朗誦社、話劇社、精武社、心理社、辯論社、望星會 、圍棋社等社團。
其他社團
據學校官方給出的資料，在學生興趣社團中，歷史悠久、成績突出的有天文觀測小組(望星會前身)、航模隊(已不存在)、生物小組(已不存在)、電子愛好者協會(已不存在)、計算機小組(已不存在)、氣象觀測小組(已不存在)、歷史興趣小組(已不存在)、崇文文學社、崇文書畫社(已不存在)等。
現存的社團有25個，活動地點如下：
| 社團名稱 | 活動地點 |
| OM社 | 崇文樓505、506 |
| 辯論社 | 崇文樓103 |
| 傳媒社 | 崇文樓102 |
| 動漫社 | 信息教室二 |
| 廣播站 | 崇文樓二樓會議室 |
| 話劇社 | 崇文樓報告廳（第一次課在電化教室1） |
| 化學社 | 科學館一樓化學實驗室 |
| 機器人社 | 崇文樓503 |
| 街舞社 | 體育館一樓舞蹈房 |
| 精武社 | 體育館門口廣場 |
| 籃球社 | 操場 |
| 朗誦社 | 校史館二樓 |
| 模聯社 | 電化教室二 |
| 模擬政協社 | 崇文樓106 |
| 魔術社 | 崇文樓504 |
| 攝影社 | 信息教室一 |
| 書法社 | 漢推樓一樓教室三 |
| 望星會 | 天象廳 |
| 圍棋社 | 崇文樓101 |
| 文學社 | 崇文樓104 |
| 舞蹈社 | 體育館一樓招辦 |
| 心理社 | 求是樓五樓半心理教室 |
| 音樂社 | 體育館一樓樂團排練廳/科學館三樓音樂教室一 |
| 排球社 | 體育館二樓 |
| 記憶社 | 崇文樓105 |
