全自動固相萃取儀的特點：一套成熟的自動固相萃取儀應該滿足自動化、模組化、經濟化、平行化、功能化、擴展化、可靠化這幾個特點。
●自動化：一套完善的自動化固相萃取系統可以真正在無人值守的情況下完成固相萃取方法的套用。有些固相萃取儀僅僅能完成部分固相萃取的步驟，不能成為自動化固相萃取儀。
●模組化：可以根據不同用戶的套用切換不用的模組，完成不同固相萃取方法的套用，如雙柱疊加。
●經濟化：一套成熟的全自動固相萃取儀應該給客戶提供經濟化的後期使用體驗。包括試劑、耗材如SPE小柱的選擇。應該可以兼容市售的主流SPE小柱供應商的產品。有些自動化固相萃取儀如賽默飛世爾科技（Thermo Fisher Scientific）旗下的戴安（Dionex）產品，美國吉爾森(Gilson.inc)，Caliper公司的產品能滿足這個要求。
●平行化：使用自動化固相萃取系統的客戶往往希望能夠平行處理，也就是同時處理多個樣品，這種對平行化的要求可以體現在固相萃取的每個步驟，包括小柱活化、上樣、清洗、洗脫。所謂平行處理也就是同時處理，有些儀器如Dionex公司的Autotrace型號在上樣步驟並不能真正的達到平行處理。 但是，在處理大體積樣品時（200mL，甚至500mL以上樣品），在固相萃取四個步驟中，真正耗費時間的是上樣環節，下表以處理一個樣品為例。可以看到實際處理一個樣品時，上樣時間幾乎占到總時間的94%。Dionex的Auto Trace 280 平衡了萃取效率和儀器成本的綜合因素，提供上樣環節支持最多6通道同時運行，其它步驟（活化、清洗、洗脫）單獨運行的設計。
| 固相萃取步驟 | 常用溶劑/樣品量 | 常用液體輸送流速（mL/min） | 該步驟所花費時間（min） |
| 活化 | 5 mL *2次 | 15 | 1 |
| 上樣 | 500 mL | 10 | 50 |
| 清洗 | 5 mL | 20 | 1 |
| 洗脫 | 3 mL | 5 | 1 |
●功能化：越來越多的實驗室會針對各類樣品進行前處理，包括食品、藥品、農業、環境等相關領域。客戶希望能夠在同一平台完成常規樣品和大體積樣品的處理。這方面美國吉爾森公司的GX-27X系列產品做的比較好，是唯一能夠在一個平台完成兩類樣品的自動化固相萃取儀。有些廠家如J2 scientific提供萃取濃縮一體化套用。
●擴展化：擴展性是從軟體和硬體上。從軟體上，擁有一個比較開放、自由的控制軟體能夠給客戶的套用方案提供更多的可行性。從硬體上，實驗室擁有品目繁多的各類實驗用試管及容器，一套成熟的自動固相萃取儀應該能夠給用戶自動自定義管架的功能。就目前而言，只有少數廠家能夠在軟體和硬體上對這個套用提供支持，如美國吉爾森公司。
●可靠化：自動化的儀器最重要的特質就是穩定、可靠。這樣才能發揮自動化的優勢，將實驗中的人為誤差降至最低。而軟體則是其中的重要一環，主流廠商如美國吉爾森公司的產品運用資料庫底核架構的軟體來控制儀器的運行，不但使得軟體更加穩定，而且方便客戶隨時調閱以往實驗的數據記錄。有些廠家往往把各類功能集合在一起，這樣反而由於功能模組的過多使得故障率偏高，往往一個模組如濃縮的問題導致整套系統癱瘓，十分影響到客戶的正常套用。
全自動固相萃取儀分類：
1、按用途可分為：小體積樣品全自動固相萃取儀和大體積樣品全自動固相萃取儀
小體積樣品指食品、藥品、血液等樣體，體積量一般在50ml以下；而大體樣品主要指水樣，一般是200ml量以上。市面上現有的全自動固相萃取儀也是通過樣品量的體積不同而設計。
小體積全自動固相萃取儀主要代表有美Gilson公司的GX-27X ASPEC，美國Caliper （原 Zymark）公司的RapidTrace，國產的優興科儀PE301等，原理基本相同，都是主要藉助注射泵來迴轉移液體來實現的，優勢在於有連續處理能力。大體積全自動固相萃取儀代表有美國DIONEX產品AutoTrace 280（樣品處理量20mL-20L），Horizon公司的SPE-DEX 4790（樣品處理量20mL-4L），以及GL Sciences公司的AQUA Trace ASPE799（樣品處理量10mL-5L）。
另外，美國Gilson公司的GX-27X ASPEC系列和而MC的MULTI-SPE A208則同時兼容小體積和大體積樣品處理的全自動固相萃取系統，同樣可以處理50ml以下的小體積樣品和200mL至數升以上的樣品。
2、按原理分可分為柱萃取和膜萃取全自動固相萃取儀
膜萃取主要為大體積水樣而設計的，膜萃取速度快是其優點，而且不容易堵塞，但是單個樣品的處理成本較柱萃取高。膜萃取主要代表Horizon公司的SPE-DEX 4790。美國Gilson公司的GX-274 ASPE，日本GL Sciences公司的AQUA Trace ASPE799也都使用柱萃取。而美國DIONEX的AutoTrace 280 和MC的MULTI-SPE A208可以同時兼容柱式和盤式萃取，也可以進行雙柱串聯萃取。
3、按通道分可分為單通道和多通道固相萃取儀
其中Gilson公司的GX-271 ASPEC為單通道，GX-274 ASPEC為四通道；Caliper （原 Zymark）公司的RapidTrace的也是單通道，但可以拼成10個通道；日本GL Sciences公司的AQUA Trace ASPE799為六通道；美國DIONEX的AutoTrace 280也為六通道；MC的MULTI-SPE 為8通道；Horizon公司的SPE-DEX 4790為單通道，也可以拼成多通道。
通常通道數量越多，在處理大批量樣品時，就可以節約更多的時間，特別是上樣的時間。
