核心思想
“中醫農業”理念是利用全球獨一的中華國粹中醫理論與農業科學進行科學的合理學科交叉所形成的的全新概念，核心是：
1）將不合理的農業生產與管理方式引導到全自然的農業生產體系，通過改進農業生態系統、提高農業生態系統的供給功能、調節功能、文化功能和支持功能，增強農業生態系統的自淨能力、農產品多功能性和綠色高效生產能力；
2）利用中醫“望聞問切”、“辯證施治”、“四氣五味”自然“療法”原理 ，降低農業生產對外（源）來石化產品依賴，減低農業源立體污染髮生機率，實現真正意義上的污染防治從根上抓起，根表兼治；
3）通過學科交叉，可以弘揚中華文化，創新一大批顛覆傳統農業生產的新理論、新技術、新方法、新產業、新體系和新學科。
主要特點
1、崇尚歸本正元自然農業生產方式與理念。可以形成不同區域上“道地”中醫農業產業、獨特的健康文化產業、產業金融合作機制（循環協作）等；
2、利用自然動植物源和礦物源等材料，通過科學配伍和生產，部分替代農業化學品的過高投入，防治農業病蟲害、動植物缺素、減少飼料添加劑用量與降低農業源立體污染髮生。
3、拓展了千年國粹中醫的套用領域，實現了與千年優質農業生產技術的有機結合，最大限度發揮農業自潔能力、深度提高農產品的多級循環利用，提升農產品質量與功能，生產出更多的農業多功能產品。探索出一條新時期中醫農業可持續發展新途徑。
科學領域
1、中醫農業資源環境科學領域
主要學科：中醫土壤學、中醫水資源利用學、中醫環境資源學、中醫環境保護學等
2、中醫農業動植物科學領域
主要學科：中醫植物學、中醫細胞學、中醫植物營養學、中醫動物學、中醫動物營養學、中醫動植物保護學、中醫植栽培學、中醫能源學與功能性種質資源學等
3、中醫農業生物科學領域
主要學科：中醫微生物學、中醫食用菌學、中醫遺傳學、中醫遺傳基因學等
4、中醫農業現代裝備和工程領域
主要學科：中醫農業工程學、現代中醫農業信息學、現代中醫農業材料學
4、中醫農業產業經濟領域
主要學科：中醫農業產業經濟學、中醫農業產業金融學、中醫農業產業戰略發展學、中醫農業智慧財產權與產業運籌學等
異同點
中醫農業與生態農業、有機農業的異同點
1、中醫農業是生態農業的重要組成部分
中醫農業尊從於生態農業的理念，是在保護、改善農業生態環境的前提下，遵循生態學、生態經濟學規律，運用系統工程方法、傳統農業的有效經驗和現代科學技術，最大限度進行資源循環利用、集約化農業經營發展，以能獲得較高的經濟效益、生態效益和社會效益的現代化農業。
2、中醫農業是基於植物源、動物園和礦物源的功能性農業
所謂中醫農業（chinese medicine agriculture)是指將國粹中醫原理、技術與方法套用於農業領域，實現現代農業與傳統中醫的跨界融合，優勢互補、集成創新。具體的說，中醫農業 基於植物源、動物園和礦物源的功能性農業，是利用中醫“系統診治”、“四診八綱”、“八法祛病”治病原理與方法，以及中醫“君、臣、佐、使”中藥配伍等技術，結合現代科學技術和工業化生產模式進行現代農業生產和經營管理，促進農產品多功能化的農業。目的是農業生產向“綠色提質、增產增效”轉型升級，成為“優質、高產、高效”可持續發展和具有中國特色的創新型現代生態健康農業。
3、中醫農業源自生態農業，更是生態 功能性 農業的 增強版
中醫農業來自生態，融入生態，開發升級於生態農業。中醫農業主要是挖掘生態農業的多功能性，並用於生態農業的多功能開發。由於中醫農業以原生態為特色，不僅解決了農業綠色增產增效問題，同時也為農業源立體污染綜合防治、農產品產地質量提升提供一系列關鍵技術與途徑。換句話說，中醫農業不僅具有生態農業和有機農業的功能，還使生態農業產品增加更多功能與作用，具有多功能農業和農業源立體污染防治農業的功能。
