中國科學院北京分院(籌)機關共設定6個處、2箇中心：綜合處、組織人事處、院地合作處、宣傳教育處、黨群工作處、紀檢監察審計處、房地產管理中心和離退休幹部服務中心。
北京分院負責聯繫和管理北京和山西地區的38個研究機構，1個教育機構，3個公共支撐單位，1個新聞單位。擁有37個國家重點實驗室和38個中國科學院重點實驗室，在基礎研究、生命科學與生物技術、高技術研究與發展等方面均具有明顯的綜合研究優勢和較強的高技術產業化能力。
北京分院系統擁有一支高水平的科技人才隊伍。2007年底，在職職工總數為1.46萬人，各類專業技術人員1.13萬人，其中高級專業技術人員0.54萬人，中國科學院院士150多人，中國工程院院士20多人；擁有博士後流動站53個，在站博士後800多人；研究生培養單位43個，在學研究生1.61萬人，其中博士研究生0.83萬人，碩士研究生0.78萬人。
京區黨委是院屬京區單位黨建工作的領導機構，與北京分院採用一個機構、兩塊牌子的形式合署辦公。京區黨委所屬京區單位共有基層黨組織56個。京區黨委的主要職能：負責院屬京區單位和院部機關黨建工作；負責全院創新文化建設工作；負責宣傳和貫徹黨的路線、方針、政策；負責院精神文明建設領導小組辦公室和院思想政治工作研究會辦公室的日常工作；領導京區紀委抓好黨風廉政建設；領導京區工會、共青團和婦工委組織，支持他們按照各自的章程獨立自主地開展工作；承擔京區統一戰線工作。
地址：北京市海淀區中關村南四街18號紫金數碼園1號樓
