三軍總醫院（Tri-ServiceGeneralHospital），簡稱三總醫院或三總，成立於1946年，為國防醫學院之教學醫院，三總與榮總、台大醫院、成大醫院、高雄醫學大學附設中和紀念醫院、中國醫藥大學附設醫院及長庚紀念醫院為中華民國最高層級的“醫學中心”級醫院，也是中華民國最高層級的國軍醫院、中華民國目前唯一醫學中心級的國軍醫院。目前在台北市有兩個院區（內湖總院及汀州院區），基隆市設有分院及民眾診療服務處各一間，澎湖縣和台北市北投區和松山區設有分院。
中華民國在國軍精進案及精粹案中，將國軍基隆總醫院(即基隆海軍醫院)裁撤，為了繼續服務基隆市及新北市附近的軍民，三總接手基隆市中正區的海軍醫院院區，在仁愛區成立民眾診療服務處。
依中華民國國防部“醫療機構總合”計畫，原國軍北投醫院(俗稱818醫院)和國軍松山總醫院(俗稱807醫院、空軍醫院、空總)更名為三軍總醫院北投分院和三軍總醫院松山分院。
