滁州市科協的宗旨是：堅持以馬克思列寧主義、毛澤東思想、鄧小平理論和“三個代表”重要思想為指導，堅持黨的基本路線，堅持建設中國特色社會主義，堅持以經濟建設為中心，堅持科學技術是第一生產力的思想，團結和動員科學技術工作者繼往開來、與時俱進，圍繞加快發展、富民強市，全面建設小康社會的奮鬥目標，實施科教興滁和可持續發展戰略，大力加速科技進步，促進科學技術的繁榮和發展，促進科學技術的普及和推廣，促進科學技術人才的成長和提高，促進科學技術與經濟的結合，為社會主義物質文明、政治文明和精神文明建設服務；反映科學技術工作者的意見，維護科學技術工作者的合法權益，為科學技術工作者服務。滁州市科協走“三主兩業一家”的發展之路，強化學術交流主渠道、科普工作主力軍、國際民間科技交流主要代表的作用，加快發展科普產業和科技諮詢產業，努力建設科技工作者之家，朝著國際化、信息化、社會化方向努力，建設學習型、創新型、開放協作型組織，提高團體自身活力，增強對科技工作者的凝聚力，提高參與經濟建設的能力。
滁州市科協是安徽省科學技術協會的地方組織，業務上接受安徽省科協的指導。
滁州市科協由市級學會、協會、研究會（以下簡稱學會）和縣（市、區）科學技術協會組成。
滁州市科協作為中國人民政治協商會議滁州市委員會的組成單位，參與本市的政治協商、民主監督、參政議政,高舉愛國主義旗幟，維護民族團結，促進祖國統一。
滁州市科協貫徹《中華人民共和國科學技術普及法》、《安徽省科學技術協會條例》和國家科學技術工作基本方針，弘揚“尊重知識、尊重人才”的風尚，倡導“獻身、創新、求實、協作”的精神，堅持獨立自主、民主辦會的原則和“百花齊放、百家爭鳴”的方針。
