核糖核酸外切酶是核糖核酸(RNA)的外切酶,是一種能降解RNA,並在5'端或3'端的核苷酸移除的酶。能移除5'端核苷酸的這種酶稱作“5'-3'核糖核酸外切酶”,而能移除3'端的則稱作“3'-5'核糖核酸外切酶”。
此類酶有兩種機理,分別是以水(水解活性)或以無機磷酸鹽(磷酸解活性)去破壞RNA上的核苷酸-核苷酸鍵。水解核糖核酸外切酶分類在EC3.1中,因以水去降解RNA,因此生成單磷酸腺苷;而以無機磷酸鹽降解的則因有外在磷酸鹽加在生成分子上,因此形成二磷酸腺苷。
核糖核酸外切酶存在於所有生命的界別,包括細菌、古菌及所有真核生物。能對不同類別的RNA種類作用,包括信使RNA、tRNA、核糖體RNA及微RNA。核糖核酸外切酶可簡單如單個蛋白質分子的(如),亦可以複雜至包含多個蛋白質分子的外切體複合物(當中包括核糖核酸外切酶的四個家族)。
主要家族
家族 成員例子 分布 催化活性
RNR 核糖核酸酶R 部分細菌及所有真核生物 3'-5'水解
核糖核酸酶II
Rrp44
DEDD 核糖核酸酶D 部分細菌及所有真核生物 3'-5'水解
核糖核酸酶T
PM/Scl-100
寡核苷酸酶
RBN RNaseBN 部分細茵 3'-5'水解
PDX PNPase 所有界 3'-5'磷酸解
PM/Scl-75
核糖核酸酶PH
RRP4 Rrp4 所有真核生物及大部分古菌 3'-5'水解
5PX 核糖核酸外切酶I 所有真核生物 5'-3'水解
核糖核酸外切酶II