昆明醫學院二附院是一所集醫療、教學、科研、預防、保健為一體的大型綜合性醫院。始建於1952年，原名“昆明市工人醫院”，1962年更名為昆明醫學院第二附屬醫院，2000年掛牌第二臨床學院。1993年1月首批被國家衛生部評定為“三級甲等醫院”，是“全國百佳醫院”和衛生部指定的國際緊急救援中心（SOS）網路醫院。
醫院現有職工1406人，其中高級職稱311人；有博士學位授權專業1個，碩士學位授權專業26個，博士、碩士生導師74人；有國家“百千萬人才”1人，雲南省中青年學術和科技帶頭人後備人才4人，享受國務院特殊津貼12人，獲雲
醫院占地面積101.3畝，改擴建後總建築面積25萬㎡，其中直接用於教學和學生公寓的建築面積為11748.14㎡。有10萬元以上大型醫療設備近200台(套)。編制病床1200張，年門診病人70.33萬餘人次，年住院病人3.85萬人次。設有56個臨床和醫技科室、15個教研室、雲南省繼續醫學教育基地9個，承擔了本科生、研究生的臨床教學、實習及基層醫院醫師進修和全省社區全科骨幹醫生培訓的教學任務。
醫院建有5個省級研究所，9個省級研究中心，6個雲南省臨床重點專科和1個省級研究室，是雲南省伽瑪刀臨床治療中心、國家藥物臨床試驗基地、雲南省化學中毒救治基地和住院醫師規範化培訓基地。近幾年來，承擔國家自然科學基金12項，攻關項目2項，國際合作1項，承擔廳級以上科研課題170項。獲科研成果獎66項，其中獲衛生部科技成果三等獎1項、中華醫學科技獎1項、省科技進步一等獎2項，出版專著57部，SCI收錄論文9篇。
醫院高度重視學科建設、人才培養和對外交流合作工作，與美、法、德、日、澳、泰、芬、瑞、新加坡、香港等10多個國家或地區的醫院有著廣泛的科研合作、人才培養協定及國際學術交流。近年來，醫院通過組織全院中層以上幹部赴新加坡、泰國等多個國家進行國際化管理培訓，使醫院的學科建設和人才培養整體水平得到提升。
