公司背景
1986年，以高知縣縣政府及和其沿線多個自治體（地方政府）等集資所組成日本第三部門鐵道，以便承接日本國有鐵道特定地方交通線中村線的後續營運。後來透過“國鐵再建法”，再投得宿毛線及阿佐線的興建權。
開業初期，公司的營運未如理想。其中，1998年及2005年先後發生了兩次重大的鐵道事故，更令資金出現經緊拙，經營環境更見惡劣。後來他們聘請了原任職近畿日本鐵道的寺田敏春為社長，並進行一系列精簡開支政策，包括採用“上下分離分式”管理資金。
2002年，土佐黑潮鐵道邀請高知縣出身的著名漫畫家柳瀨嵩（即麵包超人畫圖者）為公司進行形象推廣，設計了一連串的卡通人物及為列車設計圖案，引入觀光式走廊列車等，隨著阿佐線近年的收入有所提升，令公司這幾年的整體狀況稍為好。
歷史
•1986年
•5月8日：土佐黑潮鐵道正式成立。
•11月22日：國鐵中村線決定轉移於土佐黑潮鐵道。
•1987年2月5日：宿毛線宿毛站-中村站獲興建許可。
•1988年
•1月28日：阿佐線後免站-奈半利站獲興建許可。
•4月1日：中村線窪川 - 中村間開業。
•1997年10月1日：宿毛線宿毛 - 中村間開業。
•1998年6月11日：中村線發生事故。事後遭運輸省（即現國國土交通省）書面警告。事後公司定每年6月11日為事故防止日，進行事故演習。
•2002年7月1日：阿佐線後免 - 奈半利間開業。
•2003年12月8日：中村線荷稻站-伊與喜站因山泥傾瀉而暫停服務。
•2004年1月10日：中村線荷稻站-伊與喜站重開。
•2005年
•3月2日：宿毛站發生列車撞向車站的嚴重意外。宿毛線全線停駛。
•4月7日：宿毛線東宿毛站- 中村間普通列車重開，列車以東宿毛站為終點站。
•6月13日：宿毛線特急列車重開，仍以東宿毛站為終點站。
•11月1日：宿毛駅重開，宿毛線全線恢復營運。
•2006年3月1日：與JR四國共同為所有車站設立車站編號。
•2010年3月20日：中村站重新裝修完工，並於同年獲得多個獎項。
經營路線
現時共經營三條路線
•中村線：窪川站－中村站，43.0km，第一種鐵道事業，由國鐵中村線接手，路線簡稱為TK。
•宿毛線：中村站－宿毛站，23.6km，第一種鐵道事業，由於作為中村線的延續，加上中村、宿毛兩線也經常連在一起，所以路線簡稱也採用為TK。
•阿佐線：後免站－奈半利站，42.7km・第一種鐵道事業，路線簡稱為GN。
車款
•JR四國2000系氣動車，其中一列共四節列車歸土佐黑潮鐵道擁有及管理。用於中村線及宿毛線，能直通至土贊線、予贊線、瀨戶大橋線至岡山站、高知站及高松站。
•TKT8000形，共8輛。用於中村線及宿毛線。
•9640形，共11輛。用於阿佐線。
