國防科學技術大學機電工程與自動化學院由原國防科學技術大學自動控制系、機械電子工程與儀器繫於1999年10月合併組建,位於國防科學技術大學一號教學園區。學院的歷史沿革可以追溯到軍事工程學院時期的彈道式飛彈自動控制、帶翼式飛彈自動控制、飛彈飛行原理射擊原理與飛行試驗、引爆控制以及長沙工學院時期的精密機械與儀器加工工藝及設備等學科專業。
學院下設自動控制系、機電系、儀器科學與技術系、自動化研究所、機電工程研究所和學員大隊。
在40多年辦學歷程中,學院綜合辦學實力和水平有了很大提高,人才培養和科學研究工作取得了豐碩的成果。學院已通過GB/T19001:2000和GJB9001A-2001質量管理體系認證。學院現有2個國家級重點學科、4個湖南省“十五”重點學科;13個博士點、14個碩士點、4個工程碩士專業、4個本科專業;2個博士後科研流動站和1個軍隊院校重點實驗室。
學院培養的近6000名本科生、1000多名碩士和100多名博士奮戰在國防、軍隊建設和國民經濟、社會發展的各條戰線,為我國社會主義現代化建設事業做出了突出的貢獻。