1993年3月起公司隸屬浦東新區領導，主要職責是：1抄、受新區政府委託，統籌和調控浦東新區成片征地和預征土地；2自、發行土地債券，籌集土地發展資金；3互、根據浦東新區總體規劃，對成片徵用後的土地通過控股方式動，組織或組建有關企業進行前期開發，對部分土地進行土地使用權轉讓。
公司成立以來，已實施預征新區集體土地45.54平方公里，受讓26平方公里，實征16.89平方公里，組織編制區域結構規劃146.85平方公里，組織編制控制性詳細規劃22.42平方公里，投資有世紀公園、世紀廣場、聯洋公司、濱江公司等11個全資或控股子公司。截止2008年底，公司總資產為136.64億元，淨資產為72.46億元。在十多年的開發和經營歷程中，公司的業務不斷拓展，涵蓋了土地開發、房產開發、重大市政項目開發、會展項目開發經營等業務，承擔了世紀公園、世紀廣場、世紀大道、捷運二號線浦東3個車站等重大社會公益項目，以及行政文化中心區域、新國際博覽中心區域、東郊賓館區域等政府性項目用地的建設和開發任務，較大地改善了浦東新區的城市面貌與投資環境。
2005年3月起，根據浦府（2005）124號文《浦東新區人民政府關於上海市浦東土地發展（控股）公司職能等問題的批覆》精神，土控公司與新區土地資源儲備中心按“中心管理、企業運作”的模式共同構築新區土地儲備的新平台，履行政府有關土地儲備開發職責，籌集土地儲備開發建設資金，組織儲備土地前期開發（包括動拆遷、市政基礎設施建設和適度動遷房建設），對已具備出讓條件的土地進行日常管理，進一步強化新區政府土地儲備的調控功能。
多年來，公司為新區功能性開發和花木行政文化中心建設提供了必要的土地儲備並發揮了土地前期開發主力軍的作用，相繼實施並完成了原HQ地塊動拆遷、政府指定的土地房產收購等項目，總計投入36.21億元。公司正在推進的新區“十一五”規劃重點項目——張家浜楔形綠地實施前期開發面積4.6平方公里（規劃面積8.45平方公里），已投入前期開發資金32億元。
